More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4009 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  66.03 
 
 		 585 aa  733    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  65.99 
 
 		 584 aa  730    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  74.56 
 
 		 607 aa  805    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  68.65 
 
 		 594 aa  785    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  66.22 
 
 		 588 aa  734    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 582 aa  1159    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 		 580 aa  770    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 		 582 aa  747    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  58.74 
 
 		 610 aa  694    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 		 586 aa  749    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  68.03 
 
 		 580 aa  763    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  76.62 
 
 		 586 aa  907    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 584 aa  661    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  76.32 
 
 		 597 aa  852    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  65.14 
 
 		 585 aa  723    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  64.33 
 
 		 582 aa  719    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  70.74 
 
 		 608 aa  796    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  68.13 
 
 		 594 aa  793    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 		 581 aa  776    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  65.99 
 
 		 584 aa  730    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  70.96 
 
 		 596 aa  806    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  75.34 
 
 		 591 aa  824    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  70.45 
 
 		 599 aa  827    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  66.78 
 
 		 576 aa  746    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  69.05 
 
 		 603 aa  826    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  61.67 
 
 		 604 aa  683    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  67.69 
 
 		 582 aa  751    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  71.35 
 
 		 586 aa  787    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  62.39 
 
 		 583 aa  690    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  75.94 
 
 		 585 aa  884    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  66.32 
 
 		 582 aa  732    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  71.94 
 
 		 589 aa  833    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  65.99 
 
 		 584 aa  730    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 572 aa  463  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 570 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 567 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 567 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 571 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 574 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 575 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 572 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 587 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 571 aa  430  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 573 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 566 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 566 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 572 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 566 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 573 aa  425  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 577 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 570 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 570 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 568 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 571 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3230  prolyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 569 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 574 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 574 aa  421  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 573 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 570 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 571 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  42.86 
 
 		 570 aa  422  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 569 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 572 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 568 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 579 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 572 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 571 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  42.59 
 
 		 572 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 572 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 572 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 578 aa  418  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1758  prolyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 562 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.826128  normal  0.95234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 572 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 572 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 570 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 572 aa  418  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 574 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>