More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2494 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  70.66 
 
 		 585 aa  815    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  75.47 
 
 		 591 aa  826    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  63.23 
 
 		 582 aa  686    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  68.55 
 
 		 594 aa  793    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  75.74 
 
 		 607 aa  806    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 		 599 aa  775    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  62.54 
 
 		 582 aa  692    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  71.35 
 
 		 582 aa  794    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  71.21 
 
 		 586 aa  823    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  64.72 
 
 		 608 aa  704    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  63.49 
 
 		 580 aa  697    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  63.32 
 
 		 580 aa  687    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  76.78 
 
 		 597 aa  858    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  64.29 
 
 		 594 aa  717    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  61.1 
 
 		 585 aa  663    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 581 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 		 584 aa  694    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  59.57 
 
 		 610 aa  709    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  64.82 
 
 		 576 aa  715    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 		 584 aa  694    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  60.31 
 
 		 582 aa  646    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  64.09 
 
 		 586 aa  706    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 		 584 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  61.89 
 
 		 604 aa  694    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  62.15 
 
 		 582 aa  668    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  64.69 
 
 		 588 aa  686    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  65.67 
 
 		 596 aa  742    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  66.39 
 
 		 603 aa  775    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 586 aa  1159    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 		 583 aa  654    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  67.41 
 
 		 589 aa  763    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 		 584 aa  694    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  62.13 
 
 		 585 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 567 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 567 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 578 aa  434  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 571 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 571 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 576 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 575 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 572 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 578 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 571 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 571 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 578 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 571 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 578 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 578 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 578 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 578 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 578 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  43.37 
 
 		 570 aa  424  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 578 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 572 aa  422  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 578 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 578 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 570 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 578 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 577 aa  420  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 578 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 578 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 568 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 578 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 578 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 578 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 578 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 573 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 578 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 580 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 574 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 571 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 571 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 574 aa  415  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 571 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 570 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>