More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2059 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  66.61 
 
 		 580 aa  756    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 		 586 aa  684    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 		 582 aa  709    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  65.99 
 
 		 582 aa  730    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  66.15 
 
 		 607 aa  662    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  84.98 
 
 		 585 aa  994    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  76.79 
 
 		 585 aa  889    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 		 582 aa  783    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  72.43 
 
 		 581 aa  835    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  86.52 
 
 		 588 aa  1002    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  64.07 
 
 		 591 aa  682    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 580 aa  731    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 584 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 585 aa  746    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  69.45 
 
 		 582 aa  788    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  59.62 
 
 		 594 aa  677    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  83.05 
 
 		 582 aa  945    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  64.97 
 
 		 586 aa  736    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  62.48 
 
 		 596 aa  679    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 584 aa  1162    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 584 aa  1162    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  77.24 
 
 		 576 aa  897    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  71.58 
 
 		 586 aa  830    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 		 599 aa  682    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  59.54 
 
 		 603 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 584 aa  1162    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 		 594 aa  654    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 583 aa  743    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 597 aa  679    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  63.9 
 
 		 589 aa  717    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 608 aa  663    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  56.29 
 
 		 610 aa  634  1e-180  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  57.9 
 
 		 604 aa  623  1e-177  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 574 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 571 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 572 aa  445  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 570 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 571 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 569 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 571 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 571 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 572 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 570 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 571 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 572 aa  430  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 567 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 572 aa  430  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 570 aa  432  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  41.86 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 572 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 572 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 571 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  43.08 
 
 		 570 aa  425  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 571 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 572 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 574 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 567 aa  429  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 572 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 578 aa  423  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 572 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 574 aa  425  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 574 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 569 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 571 aa  425  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 579 aa  423  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 570 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 570 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 572 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 564 aa  421  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 584 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 566 aa  422  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 571 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 578 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 575 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 566 aa  422  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 566 aa  422  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 571 aa  422  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0982  prolyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 570 aa  419  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00893244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>