More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1906 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 594 aa  656    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 604 aa  1231    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 596 aa  683    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  64.27 
 
 		 607 aa  687    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  60.64 
 
 		 586 aa  694    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  63.38 
 
 		 591 aa  713    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  77.47 
 
 		 610 aa  985    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 597 aa  717    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 		 594 aa  723    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 585 aa  700    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  59.8 
 
 		 586 aa  704    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 		 603 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 608 aa  640    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 599 aa  671    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 581 aa  635    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  58.24 
 
 		 589 aa  658    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  60.88 
 
 		 582 aa  688    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 585 aa  625  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 584 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 586 aa  624  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 		 576 aa  624  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 588 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 584 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 584 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 580 aa  619  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 582 aa  617  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  55.59 
 
 		 582 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 585 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  54.92 
 
 		 580 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 582 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 		 582 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 583 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 584 aa  559  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 578 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 571 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 578 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 571 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 574 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 577 aa  409  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 571 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 567 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 578 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 571 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 571 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 578 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 571 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 567 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 578 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 571 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 571 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 578 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 569 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 578 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 571 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 578 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 566 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 578 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 568 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 578 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 575 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 571 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 574 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 571 aa  399  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 578 aa  399  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 566 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 571 aa  399  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 571 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 573 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 571 aa  398  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 574 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 566 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 571 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002725  prolyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 571 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0739643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 564 aa  394  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 574 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 566 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 570 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 574 aa  393  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>