202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3707 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  43.07 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  41 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  40 
 
 		 304 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  39.59 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  40.1 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  40.59 
 
 		 261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  39.9 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  39.11 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  39.11 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  39.11 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  39.6 
 
 		 261 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  38.61 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  39.6 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  39.6 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  38.12 
 
 		 266 aa  141  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  38.12 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  40.43 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  34.62 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  41.4 
 
 		 290 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1395  VacJ family lipoprotein  38.61 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0967319  normal  0.304519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  39.39 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  37.91 
 
 		 241 aa  138  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2272  lipoprotein VacJ precursor  44.19 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00759989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 		 296 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  40.21 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  40.64 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  39.46 
 
 		 340 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  37.91 
 
 		 271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03126  hypothetical protein  41.8 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  38.04 
 
 		 229 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  40.64 
 
 		 269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  40.8 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  39.36 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0140  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 		 273 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  40.33 
 
 		 338 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  36.19 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  36.96 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  37.5 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  36.96 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  39.13 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  37.57 
 
 		 315 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  37.02 
 
 		 321 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  36.41 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  38.59 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  38.97 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002850  surface lipoprotein VacJ  43.02 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  38.31 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  39.23 
 
 		 340 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  36.41 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  36.22 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  35.36 
 
 		 277 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  35.64 
 
 		 321 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  37.97 
 
 		 253 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  36.73 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  34.55 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  36.96 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  36.27 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  35.87 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  37.57 
 
 		 283 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  35.15 
 
 		 321 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  35.86 
 
 		 320 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  35.86 
 
 		 320 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  35.86 
 
 		 320 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  38.07 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  36.08 
 
 		 311 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  35.68 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  35.33 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  35.86 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  35.15 
 
 		 325 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 		 267 aa  121  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  38.71 
 
 		 249 aa  121  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  37.31 
 
 		 249 aa  121  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  36 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  38.02 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  38.2 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  35.57 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  38.2 
 
 		 319 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1336  VacJ family lipoprotein  38.25 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.134881  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  35.36 
 
 		 337 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  37.63 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  38.2 
 
 		 336 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  38.2 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  38.2 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  38.2 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  37.11 
 
 		 261 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3382  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  36.79 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 		 252 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  32.63 
 
 		 347 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  32.63 
 
 		 347 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  38.29 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  38.98 
 
 		 284 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  36.84 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  35.63 
 
 		 334 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  34.46 
 
 		 329 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  35.63 
 
 		 334 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  32.63 
 
 		 347 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  31.58 
 
 		 336 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>