202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1336 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1336  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.134881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  83.4 
 
 
253 aa  447  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  81.82 
 
 
253 aa  428  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  81.42 
 
 
253 aa  427  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3382  VacJ family lipoprotein  75.79 
 
 
252 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1505  VacJ family lipoprotein  76.19 
 
 
254 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0216408  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0386  VacJ lipoprotein  76.19 
 
 
254 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1396  lipoprotein VacJ  76.19 
 
 
254 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2621  lipoprotein, VacJ family  72.51 
 
 
251 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447032  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2532  lipoprotein, VacJ family  72.51 
 
 
251 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2581  lipoprotein VacJ family  72.51 
 
 
251 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134529  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2635  VacJ family lipoprotein  72.51 
 
 
251 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.0000000000141324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2746  lipoprotein, VacJ family  72.51 
 
 
251 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0633065  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02272  predicted lipoprotein  71.31 
 
 
251 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1311  VacJ family lipoprotein  70.92 
 
 
251 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.561225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2729  lipoprotein, VacJ family  71.31 
 
 
251 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1307  VacJ family lipoprotein  71.31 
 
 
251 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2497  VacJ family lipoprotein  71.31 
 
 
251 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02233  hypothetical protein  71.31 
 
 
251 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2505  VacJ family lipoprotein  71.31 
 
 
251 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2642  VacJ family lipoprotein  71.31 
 
 
251 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3490  lipoprotein, VacJ family  71.31 
 
 
251 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  70.52 
 
 
250 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2272  lipoprotein VacJ precursor  47.24 
 
 
261 aa  228  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00759989  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  48.89 
 
 
254 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  46.61 
 
 
249 aa  207  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03126  hypothetical protein  43.43 
 
 
263 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002850  surface lipoprotein VacJ  51.02 
 
 
257 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  40.64 
 
 
255 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  41.82 
 
 
259 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  42.27 
 
 
282 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  37.74 
 
 
276 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  38.31 
 
 
256 aa  168  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  37.36 
 
 
261 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  40.34 
 
 
255 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1395  VacJ family lipoprotein  37.84 
 
 
260 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0967319  normal  0.304519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  37.36 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  37.36 
 
 
261 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  37.36 
 
 
261 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  40.91 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  40.45 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  40.45 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  40.45 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  40.91 
 
 
321 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  37.19 
 
 
304 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  36.73 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  34.69 
 
 
266 aa  145  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  41.44 
 
 
258 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  38.2 
 
 
315 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  37.1 
 
 
266 aa  141  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  39.07 
 
 
267 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  39.81 
 
 
325 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  37.55 
 
 
281 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  37.39 
 
 
303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  36.6 
 
 
347 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  36.6 
 
 
347 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  40.74 
 
 
311 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  36.61 
 
 
347 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  40.55 
 
 
336 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  40.55 
 
 
336 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  40.74 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  36.17 
 
 
347 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  36.11 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  38.07 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  37.12 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  37.72 
 
 
320 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  37.72 
 
 
320 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  37.72 
 
 
320 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  37.4 
 
 
340 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  40.28 
 
 
319 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 
337 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  40.28 
 
 
319 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  37.28 
 
 
321 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  40.09 
 
 
336 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  40.28 
 
 
319 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  37.28 
 
 
321 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  37.21 
 
 
261 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  36.84 
 
 
318 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  35.74 
 
 
334 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  36.8 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  35.09 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  34.93 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  35.32 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  33.91 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  38.36 
 
 
277 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  36.04 
 
 
329 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  36.03 
 
 
267 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  36.44 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  35.68 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  37.67 
 
 
269 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 
250 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  35.78 
 
 
338 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 
250 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  37.95 
 
 
296 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  34.02 
 
 
340 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  34.9 
 
 
261 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
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NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  39.9 
 
 
352 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  35.59 
 
 
248 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  38.69 
 
 
296 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
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