202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1530 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



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Replicon accession
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Product
% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  100 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  46.77 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  41.25 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  40.24 
 
 		 276 aa  208  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  40 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  42.26 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  43.75 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  43.33 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  43.33 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  42.92 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  41.56 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  43.24 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  41.56 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  41.56 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  38.28 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1395  VacJ family lipoprotein  38.74 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0967319  normal  0.304519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  43.18 
 
 		 261 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  36.58 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  41.45 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03126  hypothetical protein  37.3 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  39.21 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2272  lipoprotein VacJ precursor  36.72 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00759989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  38.12 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_002850  surface lipoprotein VacJ  38.25 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  34.88 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  37.87 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1336  VacJ family lipoprotein  34.36 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.134881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  39.13 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  41.71 
 
 		 235 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  41.71 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  33.72 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  41.21 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  41.21 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  34.63 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  33.08 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3382  VacJ family lipoprotein  32.95 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  37.19 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  37.88 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  38.03 
 
 		 290 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  40.1 
 
 		 234 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  40.58 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  34.66 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  39.59 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  36.82 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  38.07 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  38.33 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  34.62 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  34.14 
 
 		 250 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  36.98 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_1505  VacJ family lipoprotein  31.94 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0216408  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1396  lipoprotein VacJ  31.94 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0386  VacJ lipoprotein  31.94 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  35.53 
 
 		 232 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A2621  lipoprotein, VacJ family  31.7 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2635  VacJ family lipoprotein  31.7 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.0000000000141324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2581  lipoprotein VacJ family  31.7 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2746  lipoprotein, VacJ family  31.7 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0633065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2532  lipoprotein, VacJ family  31.7 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  34.8 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  34.4 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  35.71 
 
 		 338 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  31.82 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02272  predicted lipoprotein  30.19 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2729  lipoprotein, VacJ family  30.19 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1307  VacJ family lipoprotein  30.19 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2497  VacJ family lipoprotein  30.19 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02233  hypothetical protein  30.19 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3490  lipoprotein, VacJ family  30.19 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2642  VacJ family lipoprotein  30.19 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2505  VacJ family lipoprotein  30.19 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  38.94 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  35.5 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1311  VacJ family lipoprotein  29.81 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.561225  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  33.94 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  34.38 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  33.61 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  33.98 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  32.51 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  33.47 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2480  VacJ-like lipoprotein  33.62 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.0468041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  31.06 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  33.33 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  35.27 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  31.8 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  32.03 
 
 		 337 aa  118  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
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NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  33.47 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  31.7 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_0140  VacJ family lipoprotein  30.85 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  31.56 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  31.56 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  35.94 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  34.48 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  36.41 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  32.14 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  30.67 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_4150  VacJ-like lipoprotein  29.66 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  33.62 
 
 		 342 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  33.62 
 
 		 310 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  33.62 
 
 		 324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  33.48 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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