202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3197 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



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Replicon accession
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% identity
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  100 
 
 		 261 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  90.8 
 
 		 261 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  90.8 
 
 		 261 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  91.19 
 
 		 261 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  88.12 
 
 		 260 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  84.67 
 
 		 261 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  85.44 
 
 		 261 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  84.67 
 
 		 261 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  83.91 
 
 		 261 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  77.39 
 
 		 255 aa  418  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1395  VacJ family lipoprotein  73.66 
 
 		 260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0967319  normal  0.304519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  73.95 
 
 		 259 aa  401  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  73.56 
 
 		 276 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  79.13 
 
 		 282 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  69.92 
 
 		 256 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  74.27 
 
 		 321 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03126  hypothetical protein  44.66 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  47.32 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2272  lipoprotein VacJ precursor  46.78 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00759989  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  40.32 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  42.67 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  42.74 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  43.18 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002850  surface lipoprotein VacJ  44.93 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3382  VacJ family lipoprotein  37.98 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  40.34 
 
 		 253 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  39.23 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1336  VacJ family lipoprotein  37.36 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.134881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  40.34 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2621  lipoprotein, VacJ family  37.22 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2746  lipoprotein, VacJ family  37.22 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0633065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2532  lipoprotein, VacJ family  37.22 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2581  lipoprotein VacJ family  37.22 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2635  VacJ family lipoprotein  37.22 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.0000000000141324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02272  predicted lipoprotein  37.22 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2505  VacJ family lipoprotein  37.22 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3490  lipoprotein, VacJ family  37.22 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02233  hypothetical protein  37.22 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2729  lipoprotein, VacJ family  37.22 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2642  VacJ family lipoprotein  37.22 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1307  VacJ family lipoprotein  37.22 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2497  VacJ family lipoprotein  37.22 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1311  VacJ family lipoprotein  36.84 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.561225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  39.81 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  39.61 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  36.98 
 
 		 250 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0386  VacJ lipoprotein  37.4 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1505  VacJ family lipoprotein  37.4 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0216408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1396  lipoprotein VacJ  37.4 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  37.96 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  38.43 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  38.46 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  38.08 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  36.79 
 
 		 290 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  40.86 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  39.61 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  40 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  39.44 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  37.38 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  36.87 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  38.46 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  36.87 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  37.98 
 
 		 233 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  36.23 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  34.43 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  36.54 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  36.23 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  37.62 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  35.1 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  37.5 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  38.36 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  40.19 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  36.07 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  41.15 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  36.54 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  38.46 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  33.47 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  36.89 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  37.76 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  37.98 
 
 		 208 aa  128  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  36.02 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  33.91 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  36.54 
 
 		 235 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  34.43 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  34.07 
 
 		 352 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  36.54 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  36.79 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  36.06 
 
 		 235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  33.85 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  36.24 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  38.24 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  37.85 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  33.61 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_0055  VacJ-like lipoprotein  30.77 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  35.12 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
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NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  33.46 
 
 		 350 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  37.38 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
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NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  36.32 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
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NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  33.65 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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