202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1655 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  100 
 
 
249 aa  518  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  49.19 
 
 
250 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02272  predicted lipoprotein  47.39 
 
 
251 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1311  VacJ family lipoprotein  47.39 
 
 
251 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.561225  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2505  VacJ family lipoprotein  47.39 
 
 
251 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02233  hypothetical protein  47.39 
 
 
251 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2497  VacJ family lipoprotein  47.39 
 
 
251 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2642  VacJ family lipoprotein  47.39 
 
 
251 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2729  lipoprotein, VacJ family  47.39 
 
 
251 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1307  VacJ family lipoprotein  47.39 
 
 
251 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3490  lipoprotein, VacJ family  47.39 
 
 
251 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  51.11 
 
 
253 aa  228  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2746  lipoprotein, VacJ family  46.59 
 
 
251 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0633065  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2621  lipoprotein, VacJ family  46.59 
 
 
251 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447032  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2532  lipoprotein, VacJ family  46.59 
 
 
251 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2581  lipoprotein VacJ family  46.59 
 
 
251 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134529  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2635  VacJ family lipoprotein  46.59 
 
 
251 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.0000000000141324 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  46.15 
 
 
253 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3382  VacJ family lipoprotein  44.94 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1505  VacJ family lipoprotein  45.08 
 
 
254 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0216408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1396  lipoprotein VacJ  45.08 
 
 
254 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  45.83 
 
 
253 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0386  VacJ lipoprotein  45.08 
 
 
254 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1336  VacJ family lipoprotein  46.61 
 
 
253 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.134881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2272  lipoprotein VacJ precursor  48.37 
 
 
261 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00759989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  43.03 
 
 
255 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03126  hypothetical protein  40.56 
 
 
263 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  45.45 
 
 
254 aa  179  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002850  surface lipoprotein VacJ  46.19 
 
 
257 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  38.62 
 
 
256 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  39.27 
 
 
276 aa  165  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  37.86 
 
 
304 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  38.84 
 
 
259 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  38.16 
 
 
261 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  37.07 
 
 
282 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 
261 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  36.59 
 
 
255 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 
261 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  39.61 
 
 
261 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  37.9 
 
 
261 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  38.65 
 
 
260 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1395  VacJ family lipoprotein  38.01 
 
 
260 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0967319  normal  0.304519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  40.59 
 
 
321 aa  156  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  39.13 
 
 
261 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  39.13 
 
 
261 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  36.7 
 
 
261 aa  155  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  40.74 
 
 
271 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  37.93 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  37.5 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  37.93 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  37.28 
 
 
337 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  37.29 
 
 
321 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  36.64 
 
 
329 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  36.86 
 
 
321 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  40.87 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  36.02 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  40.87 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  41.35 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  40.1 
 
 
325 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  39.61 
 
 
320 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  39.61 
 
 
320 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  39.61 
 
 
320 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  39.53 
 
 
340 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  40.58 
 
 
311 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  40.38 
 
 
336 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  40.38 
 
 
319 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  40.38 
 
 
319 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  40.38 
 
 
319 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  36.71 
 
 
347 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  34.08 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  35.08 
 
 
303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  37.93 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  36.87 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  38.6 
 
 
338 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  35.42 
 
 
234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  34.16 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  36.12 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  35.42 
 
 
234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  35.95 
 
 
267 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  35.83 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  36.28 
 
 
291 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  36.6 
 
 
290 aa  131  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  35.2 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  36.51 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  34.91 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  34.91 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  36.29 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  35.59 
 
 
330 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  35.09 
 
 
324 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  35.59 
 
 
330 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  36 
 
 
315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  34.76 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal 
 
 
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NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  39.11 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
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NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  34.76 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  34.63 
 
 
234 aa  128  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  38.26 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
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NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  35.78 
 
 
330 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  35.78 
 
 
327 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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