202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03065 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  54.37 
 
 		 255 aa  269  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  42.34 
 
 		 266 aa  205  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  40.56 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  39.84 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  42.66 
 
 		 261 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  39.44 
 
 		 259 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  40 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  40.32 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  41.63 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1395  VacJ family lipoprotein  40.8 
 
 		 260 aa  199  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0967319  normal  0.304519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  40.68 
 
 		 261 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  40.68 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  38.4 
 
 		 261 aa  198  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  38.4 
 
 		 261 aa  198  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  40.81 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  40.25 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  42.6 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  37.4 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  40 
 
 		 321 aa  182  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  37.86 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  42.93 
 
 		 234 aa  162  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  36.02 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2272  lipoprotein VacJ precursor  34.57 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00759989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  37.74 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  35.69 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2581  lipoprotein VacJ family  36.96 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2621  lipoprotein, VacJ family  36.96 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  42.08 
 
 		 234 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2635  VacJ family lipoprotein  36.96 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.0000000000141324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2746  lipoprotein, VacJ family  36.96 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0633065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2532  lipoprotein, VacJ family  36.96 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1311  VacJ family lipoprotein  37.6 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.561225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03126  hypothetical protein  36.68 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02272  predicted lipoprotein  37.19 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2642  VacJ family lipoprotein  37.19 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3490  lipoprotein, VacJ family  37.19 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2497  VacJ family lipoprotein  37.19 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2505  VacJ family lipoprotein  37.19 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02233  hypothetical protein  37.19 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1307  VacJ family lipoprotein  37.19 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2729  lipoprotein, VacJ family  37.19 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  39.51 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  39.6 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  40.48 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  38.52 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  36.73 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  39.11 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1336  VacJ family lipoprotein  37.19 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.134881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  39.05 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002850  surface lipoprotein VacJ  38.38 
 
 		 257 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  41.71 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  35.98 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  38.43 
 
 		 296 aa  148  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  39.8 
 
 		 235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  39.29 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  38.57 
 
 		 235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  40.56 
 
 		 221 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  39.3 
 
 		 234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0140  VacJ family lipoprotein  34.78 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  34.73 
 
 		 253 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  34.75 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  34.68 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  39.41 
 
 		 208 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  38.12 
 
 		 261 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  34.39 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  38.31 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  34.73 
 
 		 249 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3382  VacJ family lipoprotein  35.15 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  36.91 
 
 		 250 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  36.18 
 
 		 277 aa  142  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  36.91 
 
 		 250 aa  142  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  36.45 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  32.3 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  38.24 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  40.1 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  33.2 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  36.6 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  31.71 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  31.71 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  34.31 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  39.27 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  33.46 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  37.56 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  33.46 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  34.5 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  32.84 
 
 		 347 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  32.24 
 
 		 249 aa  135  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  32.91 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  34.32 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  33.94 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  34.55 
 
 		 252 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  33.75 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  34.98 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  32.13 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  33.86 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  33.95 
 
 		 352 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1505  VacJ family lipoprotein  32.22 
 
 		 254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0216408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1396  lipoprotein VacJ  32.22 
 
 		 254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>