202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2505 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



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Replicon accession
Locus tag
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% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02272  predicted lipoprotein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1311  VacJ family lipoprotein  99.6 
 
 		 251 aa  517  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.561225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1307  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2729  lipoprotein, VacJ family  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2642  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02233  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2497  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2505  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3490  lipoprotein, VacJ family  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2746  lipoprotein, VacJ family  94.42 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0633065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2532  lipoprotein, VacJ family  94.42 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2581  lipoprotein VacJ family  94.42 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2635  VacJ family lipoprotein  94.42 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.0000000000141324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2621  lipoprotein, VacJ family  94.42 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  86.06 
 
 		 250 aa  460  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3382  VacJ family lipoprotein  78.17 
 
 		 252 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1396  lipoprotein VacJ  75 
 
 		 254 aa  397  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0386  VacJ lipoprotein  75 
 
 		 254 aa  397  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1505  VacJ family lipoprotein  75 
 
 		 254 aa  397  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0216408  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  70.92 
 
 		 253 aa  384  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  71.31 
 
 		 253 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1336  VacJ family lipoprotein  71.31 
 
 		 253 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.134881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  70.52 
 
 		 253 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  47.39 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2272  lipoprotein VacJ precursor  47.37 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00759989  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  46.67 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_03126  hypothetical protein  43.23 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002850  surface lipoprotein VacJ  45.92 
 
 		 257 aa  184  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  40.64 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  36.82 
 
 		 276 aa  168  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  40.45 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  37.74 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1395  VacJ family lipoprotein  41.36 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0967319  normal  0.304519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  42.2 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  39.55 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  38.62 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  39.09 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  39.09 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  37.22 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  36.6 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  36.6 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  39.09 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  40 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  39.15 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  37.19 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  41.79 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  35.87 
 
 		 256 aa  141  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  37.23 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  35.86 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  36.82 
 
 		 347 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  42.08 
 
 		 301 aa  135  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  36.57 
 
 		 271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  35.16 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  38.49 
 
 		 336 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  40.93 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  40.09 
 
 		 325 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  39.91 
 
 		 336 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  36.02 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  39.91 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  35.96 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  37.84 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  37.93 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  39.46 
 
 		 336 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  39.46 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  39.46 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  35.59 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  39.46 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  36.32 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  35.89 
 
 		 340 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  34.75 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  34.57 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  37.22 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  38.32 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  38.32 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  35.95 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  38.32 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  37.85 
 
 		 321 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  37.85 
 
 		 321 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  36.56 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  37.05 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  37.38 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  38.05 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  36.73 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  38.29 
 
 		 352 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  33.19 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  38.46 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  36.8 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  33.33 
 
 		 337 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  31.33 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  34.44 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  34.19 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  32.64 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  32.22 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  32.22 
 
 		 347 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  32.22 
 
 		 347 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  36.95 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  33.91 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003296  RS01688  lipoprotein  37.06 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  35.09 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  39 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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