202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0688 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
261 aa  529  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  71.3 
 
 
266 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  60.25 
 
 
250 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  60.33 
 
 
250 aa  289  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  58.95 
 
 
277 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  58.05 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  58.37 
 
 
248 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  56.78 
 
 
303 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  55.36 
 
 
267 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  55.36 
 
 
267 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  57.14 
 
 
269 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  53.75 
 
 
260 aa  257  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  58.65 
 
 
281 aa  255  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  55.16 
 
 
277 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  48.76 
 
 
291 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  52.34 
 
 
336 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  52.34 
 
 
319 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  55.12 
 
 
266 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  50.43 
 
 
338 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  51.04 
 
 
252 aa  238  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  56.25 
 
 
311 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  55.98 
 
 
336 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  50.87 
 
 
340 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  51.49 
 
 
319 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  51.49 
 
 
319 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  51.49 
 
 
336 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  51.49 
 
 
319 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  52.74 
 
 
325 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  52.38 
 
 
320 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  52.38 
 
 
320 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  52.38 
 
 
320 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  52.17 
 
 
318 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  51.95 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  55.34 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  51.2 
 
 
336 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  51.82 
 
 
249 aa  232  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  44.4 
 
 
347 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  51.14 
 
 
315 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  44.4 
 
 
347 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  44.4 
 
 
347 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  46.86 
 
 
321 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  43.82 
 
 
329 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  46.96 
 
 
342 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  46.96 
 
 
310 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  46.46 
 
 
334 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  46.96 
 
 
324 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  47.77 
 
 
269 aa  225  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  48.84 
 
 
330 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  46.4 
 
 
334 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  48.84 
 
 
330 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  48.84 
 
 
330 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  48.84 
 
 
327 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  47.44 
 
 
337 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  50.95 
 
 
340 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  48.29 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  48.07 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  48.95 
 
 
263 aa  218  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  50.23 
 
 
262 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  48.21 
 
 
245 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  47.62 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  46.89 
 
 
271 aa  206  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  44.4 
 
 
249 aa  194  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  46.43 
 
 
233 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  45.18 
 
 
235 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  46.05 
 
 
235 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  44.3 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  47.34 
 
 
235 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  45.67 
 
 
336 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  49.01 
 
 
234 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  46.67 
 
 
290 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  45.09 
 
 
233 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  46.77 
 
 
229 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  47.42 
 
 
352 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  44.05 
 
 
296 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  44.1 
 
 
258 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  43.69 
 
 
284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  44.55 
 
 
234 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  47.94 
 
 
350 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  43.6 
 
 
234 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  47.42 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  46.97 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  45.64 
 
 
208 aa  171  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  43.2 
 
 
220 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  38.82 
 
 
280 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  38.82 
 
 
279 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  40.27 
 
 
260 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  41.3 
 
 
261 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  39.37 
 
 
260 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  43 
 
 
315 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  38.53 
 
 
260 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  41.29 
 
 
295 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  39.27 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008044  TM1040_2480  VacJ-like lipoprotein  38.62 
 
 
266 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.0468041 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  40.19 
 
 
232 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  44.71 
 
 
274 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  44.12 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0995  VacJ-like lipoprotein  41.76 
 
 
747 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.4612 
 
 
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NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  44.12 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
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NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  38.43 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal 
 
 
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NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  34.78 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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