202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2787 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



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Alignment on homolog gene

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  100 
 
 
271 aa  552  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  48.92 
 
 
321 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  48.92 
 
 
320 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  48.92 
 
 
320 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  48.92 
 
 
320 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  48.48 
 
 
318 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  48.05 
 
 
325 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  48.48 
 
 
321 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  46.29 
 
 
266 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  47.58 
 
 
315 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  47.44 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  47.44 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  47.44 
 
 
319 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  41.76 
 
 
267 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  47.44 
 
 
311 aa  214  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  41.13 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  45.89 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  47.01 
 
 
319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  48.43 
 
 
241 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  47.01 
 
 
319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  47.01 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  47.01 
 
 
319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  45.23 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  46.19 
 
 
261 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  45.11 
 
 
347 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  42.18 
 
 
284 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  48.1 
 
 
340 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  44 
 
 
347 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  45.12 
 
 
336 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  44 
 
 
347 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  44 
 
 
347 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  42.91 
 
 
329 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  45.63 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  45.13 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  45.58 
 
 
334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  44.26 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  47.39 
 
 
334 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  47.47 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  43.78 
 
 
290 aa  199  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  43.2 
 
 
291 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  40.57 
 
 
269 aa  198  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  48.57 
 
 
338 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  48.57 
 
 
340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  44.73 
 
 
263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  43.64 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  46.78 
 
 
267 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  45.41 
 
 
277 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  45.15 
 
 
260 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  46.85 
 
 
232 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  44.19 
 
 
266 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  43.98 
 
 
258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  43.67 
 
 
342 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  43.67 
 
 
310 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  43.67 
 
 
324 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  42.11 
 
 
249 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  43.23 
 
 
248 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  43.23 
 
 
330 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  42.13 
 
 
321 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  44.69 
 
 
283 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  43.23 
 
 
330 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  43.23 
 
 
330 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  43.23 
 
 
327 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  40.85 
 
 
252 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  43.59 
 
 
234 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  44.89 
 
 
234 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  38.93 
 
 
249 aa  185  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  44.19 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  41.35 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  43.84 
 
 
234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  43.35 
 
 
315 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  42.48 
 
 
250 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  43.46 
 
 
235 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  43.38 
 
 
234 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  45.1 
 
 
250 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  43.46 
 
 
235 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  43.84 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  44.06 
 
 
235 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  43.06 
 
 
235 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  41.96 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  41.86 
 
 
336 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  43.58 
 
 
233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  46.61 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  42.47 
 
 
261 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  43.35 
 
 
220 aa  168  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  40.83 
 
 
229 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  41.84 
 
 
352 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  41.05 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  43.65 
 
 
251 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  42.31 
 
 
260 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  41.83 
 
 
260 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  36.44 
 
 
285 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  39 
 
 
249 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  34.25 
 
 
304 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  42.19 
 
 
254 aa  156  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  38.62 
 
 
317 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  36.17 
 
 
350 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1154  VacJ family lipoprotein  38.17 
 
 
273 aa  156  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  36.68 
 
 
230 aa  156  4e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2594  VacJ family lipoprotein  40.19 
 
 
270 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.123162  normal 
 
 
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NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  36.25 
 
 
250 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
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