202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2767 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Replicon accession

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Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
315 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  64.25 
 
 
347 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  67.18 
 
 
340 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  76.86 
 
 
311 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  66.45 
 
 
336 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  76.52 
 
 
336 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  76.09 
 
 
319 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  76.09 
 
 
336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  76.09 
 
 
319 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  76.09 
 
 
319 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  76.09 
 
 
319 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  60.55 
 
 
321 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  70.85 
 
 
325 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  61.35 
 
 
320 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  60.24 
 
 
321 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  61.35 
 
 
320 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  61.35 
 
 
320 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  61.11 
 
 
318 aa  342  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  52.04 
 
 
338 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  55.74 
 
 
277 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  51.52 
 
 
340 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  52.16 
 
 
267 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  48.9 
 
 
321 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  50 
 
 
291 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  51.76 
 
 
267 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  51.75 
 
 
336 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  45.64 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  47.72 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  47.37 
 
 
347 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  47.37 
 
 
347 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  49.15 
 
 
337 aa  241  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  53.78 
 
 
269 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  48.26 
 
 
342 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  48.26 
 
 
310 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  48.64 
 
 
324 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  47.88 
 
 
330 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  47.88 
 
 
330 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  46.74 
 
 
334 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  48.25 
 
 
330 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  48.25 
 
 
327 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  46.12 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  49.61 
 
 
266 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  45.29 
 
 
269 aa  225  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  52 
 
 
303 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  51.92 
 
 
261 aa  222  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  47.81 
 
 
263 aa  218  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  49.52 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  54.17 
 
 
260 aa  216  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  46.38 
 
 
283 aa  215  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  49.52 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  45.82 
 
 
252 aa  212  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  50.23 
 
 
235 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  47.81 
 
 
250 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  47.81 
 
 
250 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  48.58 
 
 
266 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  44.62 
 
 
249 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  48.36 
 
 
235 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  49.75 
 
 
235 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  46.61 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  45.22 
 
 
235 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  47.58 
 
 
234 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  46.64 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  47.49 
 
 
234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  45.45 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  51.23 
 
 
234 aa  195  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  46.58 
 
 
234 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  40.98 
 
 
284 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  48.24 
 
 
233 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  45.19 
 
 
258 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  45.92 
 
 
262 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  41.77 
 
 
277 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  43.81 
 
 
245 aa  191  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  49.28 
 
 
296 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  45.25 
 
 
241 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  50.78 
 
 
208 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  44.8 
 
 
233 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  47.03 
 
 
248 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  43.52 
 
 
290 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  41.35 
 
 
280 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  42.22 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  42.98 
 
 
261 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  44.28 
 
 
220 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  40.29 
 
 
295 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  39.71 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  42.27 
 
 
233 aa  162  6e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  46.91 
 
 
290 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  41.38 
 
 
260 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  40.95 
 
 
260 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  40.93 
 
 
352 aa  156  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  43.22 
 
 
301 aa  155  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  42.05 
 
 
296 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  39.11 
 
 
315 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  35.61 
 
 
260 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  35.81 
 
 
230 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1154  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 
273 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  40.62 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  37.2 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1239  VacJ family lipoprotein  46.71 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.530475 
 
 
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NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  35.91 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  37.21 
 
 
242 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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