202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2450 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  100 
 
 
263 aa  539  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  51.22 
 
 
261 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  51.82 
 
 
229 aa  221  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  55.28 
 
 
234 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  51.34 
 
 
233 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  47.81 
 
 
315 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  52.68 
 
 
233 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  50.68 
 
 
234 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  52.29 
 
 
235 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  50.68 
 
 
234 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  50.45 
 
 
269 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  50.45 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  50.46 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  51.17 
 
 
261 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  50.44 
 
 
281 aa  215  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  51.38 
 
 
235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  50 
 
 
234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  48.05 
 
 
320 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  48.05 
 
 
320 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  48.05 
 
 
320 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  50 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  51.63 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  48.03 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  47.19 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  50.46 
 
 
235 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  48.05 
 
 
325 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  47.6 
 
 
321 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  47.16 
 
 
347 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  52.13 
 
 
338 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  52.36 
 
 
340 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  49 
 
 
249 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  49.05 
 
 
340 aa  208  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  50 
 
 
336 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  50 
 
 
319 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  50.22 
 
 
277 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  50 
 
 
336 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  45.98 
 
 
347 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  50 
 
 
258 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  46.67 
 
 
303 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  48.18 
 
 
342 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  48.18 
 
 
310 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  48.18 
 
 
324 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  50.94 
 
 
266 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  45.98 
 
 
347 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  45.98 
 
 
347 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  50 
 
 
336 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  53.96 
 
 
296 aa  205  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  50 
 
 
319 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  50 
 
 
319 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  50 
 
 
319 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  49.28 
 
 
311 aa  205  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  46.7 
 
 
337 aa  204  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  52.26 
 
 
235 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  45.98 
 
 
329 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  49.28 
 
 
266 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  47.73 
 
 
330 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  47.73 
 
 
330 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  47.73 
 
 
330 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  47.73 
 
 
327 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  50 
 
 
283 aa  203  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  50.68 
 
 
250 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  45.09 
 
 
334 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  45.09 
 
 
334 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  50.5 
 
 
290 aa  201  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  47.71 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  51.94 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  48.99 
 
 
208 aa  198  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  43.78 
 
 
277 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  48.1 
 
 
271 aa  195  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  43.97 
 
 
248 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  47.73 
 
 
245 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  50.45 
 
 
262 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  45.25 
 
 
269 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  43.3 
 
 
291 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  39.85 
 
 
284 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  46.48 
 
 
336 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  44.25 
 
 
249 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  46.05 
 
 
252 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  42.47 
 
 
241 aa  185  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  45.59 
 
 
220 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  42.08 
 
 
336 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  40.89 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  41.63 
 
 
315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  40.62 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  42.86 
 
 
321 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  45.37 
 
 
295 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  40.54 
 
 
261 aa  159  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  40.09 
 
 
261 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  38.43 
 
 
256 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  40.09 
 
 
261 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  40.09 
 
 
261 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  37.02 
 
 
259 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  39.64 
 
 
261 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  39.64 
 
 
261 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  39.64 
 
 
261 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  41.75 
 
 
352 aa  156  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  36.58 
 
 
276 aa  155  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  39.81 
 
 
282 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  37.3 
 
 
255 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  40.99 
 
 
285 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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