202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1154 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1154  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0220  VacJ family lipoprotein  41.53 
 
 
290 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  40.39 
 
 
291 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  40.16 
 
 
277 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  39.48 
 
 
347 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  38.96 
 
 
337 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  38.56 
 
 
329 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 
315 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  36.71 
 
 
319 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  39.19 
 
 
271 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  40.4 
 
 
340 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  36.71 
 
 
336 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  38.18 
 
 
336 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  36.29 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  36.29 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  38.91 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  38.91 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  38.91 
 
 
347 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  37.79 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  36.29 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  36.29 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  38.91 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  37.85 
 
 
311 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  38.03 
 
 
334 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  37.2 
 
 
232 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  38.77 
 
 
330 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  38.77 
 
 
327 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  38.77 
 
 
330 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  38.77 
 
 
324 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  38.77 
 
 
330 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  38.77 
 
 
342 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  38.77 
 
 
310 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  38.1 
 
 
303 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  38.77 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  37.61 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  37.8 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  37.8 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  37.8 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  37.16 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  37.32 
 
 
321 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  37.32 
 
 
321 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  37.69 
 
 
325 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  35.32 
 
 
317 aa  138  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  36.84 
 
 
318 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  34.89 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  36.07 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2594  VacJ family lipoprotein  34.72 
 
 
270 aa  135  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.123162  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  35.17 
 
 
260 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  38.6 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  35 
 
 
284 aa  133  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  34.82 
 
 
269 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  35.94 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  33.2 
 
 
267 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  35.68 
 
 
295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  38.16 
 
 
241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  34.55 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  33.19 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  32.28 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  37.7 
 
 
315 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  34.5 
 
 
245 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  30.96 
 
 
252 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  31.78 
 
 
280 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  31.78 
 
 
279 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  33.33 
 
 
258 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  32.88 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  32.61 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  36.67 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  34.55 
 
 
263 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  34.01 
 
 
290 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  34.05 
 
 
260 aa  118  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  32.33 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  33.8 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  36.02 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  32.27 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  31.74 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0140  VacJ family lipoprotein  30.77 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  32.74 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  35.75 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0055  VacJ-like lipoprotein  35.1 
 
 
290 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.743056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  31.14 
 
 
281 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  34.65 
 
 
262 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  34.82 
 
 
249 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  33.33 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  33.62 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  30.97 
 
 
277 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  35 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  30.43 
 
 
235 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1281  conserved hypothetical protein, VacJ family  30.08 
 
 
228 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  32.26 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
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NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  31.17 
 
 
233 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  32.73 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  32.66 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_1359  VacJ-like lipoprotein  30.19 
 
 
350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.022936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  31.16 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  33.48 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal 
 
 
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NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  36.63 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_2480  VacJ-like lipoprotein  29.36 
 
 
266 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.0468041 
 
 
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NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  31.39 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
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NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  32.88 
 
 
234 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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