202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5533 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
267 aa  539  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  70.48 
 
 
250 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  68.83 
 
 
250 aa  309  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  66.38 
 
 
260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  61.99 
 
 
277 aa  268  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  60.47 
 
 
261 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  57.74 
 
 
281 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  57.52 
 
 
248 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  59.31 
 
 
266 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  54.36 
 
 
269 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  52.59 
 
 
267 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  52.59 
 
 
267 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  52.17 
 
 
338 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  52.17 
 
 
340 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  48.7 
 
 
249 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  48.23 
 
 
336 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  50.22 
 
 
303 aa  214  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  51.66 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  48.83 
 
 
337 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  48.67 
 
 
336 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  48.67 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  51.63 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  48.67 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  48.36 
 
 
329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  46.78 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  48.44 
 
 
311 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  43.85 
 
 
269 aa  211  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  48.23 
 
 
336 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  48.23 
 
 
319 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  47.42 
 
 
347 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  48.23 
 
 
319 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  48.23 
 
 
319 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  47.42 
 
 
347 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  47.42 
 
 
347 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  47.42 
 
 
334 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  47.26 
 
 
277 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  47.2 
 
 
334 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  50.73 
 
 
320 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  50.73 
 
 
320 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  50.73 
 
 
320 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  50.73 
 
 
325 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  46.32 
 
 
283 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  50.24 
 
 
321 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  50.24 
 
 
321 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  49.76 
 
 
318 aa  205  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  45.41 
 
 
330 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  46.09 
 
 
324 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  45.41 
 
 
330 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  46.82 
 
 
291 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  45.41 
 
 
330 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  45.41 
 
 
327 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  46.09 
 
 
342 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  46.09 
 
 
310 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  44.02 
 
 
321 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  46.25 
 
 
262 aa  201  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  46.61 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  45.22 
 
 
233 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  47.2 
 
 
245 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  43.56 
 
 
241 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  43.91 
 
 
233 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  43.1 
 
 
235 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  42.67 
 
 
235 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  45.11 
 
 
347 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  46.8 
 
 
235 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  43.21 
 
 
249 aa  188  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  43.91 
 
 
340 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  43.1 
 
 
235 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  47.91 
 
 
271 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  49.51 
 
 
296 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  42.22 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  43.86 
 
 
234 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  46.93 
 
 
261 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  40.76 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  40.76 
 
 
234 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  47.74 
 
 
336 aa  175  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  43.33 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  42.36 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  40.44 
 
 
234 aa  168  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  42.11 
 
 
315 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  42.38 
 
 
295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  35.69 
 
 
304 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  37.12 
 
 
284 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  39.62 
 
 
290 aa  159  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  43.14 
 
 
220 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  46.32 
 
 
352 aa  157  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  42.73 
 
 
350 aa  156  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  40 
 
 
251 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  42.53 
 
 
285 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  38.89 
 
 
260 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  37.24 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  40.55 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  42.5 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  40.09 
 
 
232 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  42.79 
 
 
274 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  38.37 
 
 
255 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0140  VacJ family lipoprotein  36.82 
 
 
273 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  45.66 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  41.29 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  40 
 
 
250 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
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NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  41.09 
 
 
259 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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