202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3247 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  54.37 
 
 		 304 aa  269  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  46.91 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  44.92 
 
 		 276 aa  218  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  47.77 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  45.04 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  47.77 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  47.77 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  47.56 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  47.32 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  47.32 
 
 		 261 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  44.4 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1395  VacJ family lipoprotein  42.37 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0967319  normal  0.304519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  43.75 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  43.57 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  43.57 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  46.88 
 
 		 282 aa  205  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  44.3 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  42.97 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  43.03 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  47.29 
 
 		 321 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2272  lipoprotein VacJ precursor  40.39 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00759989  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03126  hypothetical protein  40 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  40.56 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  38.37 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  41.04 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  40.69 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1336  VacJ family lipoprotein  40.64 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.134881  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  42.48 
 
 		 233 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  43.36 
 
 		 229 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3382  VacJ family lipoprotein  40 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2635  VacJ family lipoprotein  41.43 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.0000000000141324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2532  lipoprotein, VacJ family  41.43 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2621  lipoprotein, VacJ family  41.43 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2581  lipoprotein VacJ family  41.43 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2746  lipoprotein, VacJ family  41.43 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0633065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  43.64 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002850  surface lipoprotein VacJ  41.2 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  43.18 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02272  predicted lipoprotein  40.64 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1311  VacJ family lipoprotein  40.64 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.561225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2729  lipoprotein, VacJ family  40.64 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1307  VacJ family lipoprotein  40.64 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2505  VacJ family lipoprotein  40.64 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2497  VacJ family lipoprotein  40.64 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02233  hypothetical protein  40.64 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3490  lipoprotein, VacJ family  40.64 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2642  VacJ family lipoprotein  40.64 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  40 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.231217 
 
 
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NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  41.88 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  43.56 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  46.12 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  44.83 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  44.44 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  45.63 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1396  lipoprotein VacJ  38.25 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0386  VacJ lipoprotein  38.25 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1505  VacJ family lipoprotein  38.25 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0216408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  42.27 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  43.07 
 
 		 208 aa  158  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  37.39 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  38.24 
 
 		 263 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  40.28 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  38.37 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  35.17 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  37.78 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  38.52 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  38.2 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  37.04 
 
 		 267 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  41.75 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  36.86 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  37.93 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  37.44 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  36.07 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  38.72 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  35.81 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  39.83 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  38.72 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  39.48 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  37.07 
 
 		 315 aa  138  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  39.06 
 
 		 338 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  40.54 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  35.96 
 
 		 329 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  35.29 
 
 		 337 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  35.54 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  36.77 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  34.87 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
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NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  35.2 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  34.87 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  35.29 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  34.87 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  34.87 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
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NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  36.53 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  36.84 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
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NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  36.68 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_0140  VacJ family lipoprotein  38.33 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  34.33 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  34.33 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  35.62 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
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