202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1680 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
235 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  94.89 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  94.89 
 
 
235 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  95.32 
 
 
235 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  74.04 
 
 
233 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  79.46 
 
 
229 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  74.89 
 
 
233 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  69.36 
 
 
234 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  71.06 
 
 
234 aa  340  9e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  68.94 
 
 
234 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  67.8 
 
 
234 aa  327  7e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  65.22 
 
 
208 aa  295  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  50.91 
 
 
263 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  46.82 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  50.49 
 
 
296 aa  211  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  49.36 
 
 
258 aa  208  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  47.64 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  47.42 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  47.14 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  47.55 
 
 
340 aa  193  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  44.34 
 
 
291 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  47 
 
 
220 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  41.84 
 
 
249 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  43.1 
 
 
267 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  45.07 
 
 
277 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  44.78 
 
 
267 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  41.67 
 
 
252 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  45 
 
 
338 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  45.74 
 
 
267 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  48.26 
 
 
261 aa  185  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  45.16 
 
 
277 aa  185  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  44.98 
 
 
321 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  44.98 
 
 
320 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  44.98 
 
 
321 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  44.98 
 
 
320 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  44.98 
 
 
320 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  46.6 
 
 
311 aa  184  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  47.06 
 
 
336 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  47.06 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  44.5 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  44.5 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  44.55 
 
 
340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  47.06 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  45.45 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  45.37 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  46.57 
 
 
336 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  46.57 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  46.57 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  46.57 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  46.83 
 
 
261 aa  181  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  45.09 
 
 
248 aa  178  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  40.36 
 
 
347 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  42.79 
 
 
290 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  40.36 
 
 
347 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  39.91 
 
 
334 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  39.91 
 
 
334 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  40.36 
 
 
347 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  39.91 
 
 
337 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  40.74 
 
 
329 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  44.22 
 
 
271 aa  175  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  43.81 
 
 
303 aa  175  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  44.72 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  39.65 
 
 
342 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  39.65 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  39.65 
 
 
324 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  44.17 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  39.21 
 
 
330 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  39.21 
 
 
330 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  46.84 
 
 
336 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  44.67 
 
 
284 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  39.21 
 
 
330 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  39.21 
 
 
327 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  40.74 
 
 
321 aa  171  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  42.66 
 
 
245 aa  171  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  44.12 
 
 
250 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  44.12 
 
 
250 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  43.14 
 
 
283 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  42.27 
 
 
255 aa  168  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  39.35 
 
 
281 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  43.48 
 
 
275 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  40.79 
 
 
262 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  43.48 
 
 
248 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  44.44 
 
 
274 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  43.94 
 
 
274 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  39.51 
 
 
304 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1239  VacJ family lipoprotein  42.51 
 
 
256 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  39.21 
 
 
315 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  42.21 
 
 
295 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  41.06 
 
 
270 aa  151  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  38.36 
 
 
260 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  42.64 
 
 
315 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  51.47 
 
 
267 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  36.27 
 
 
296 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  37.9 
 
 
260 aa  148  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  41.21 
 
 
266 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0995  VacJ-like lipoprotein  36.18 
 
 
747 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.4612 
 
 
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NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  37.62 
 
 
336 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
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NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  39 
 
 
257 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  41.04 
 
 
295 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal 
 
 
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