202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2280 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 315 aa  639    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  53.52 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  49.32 
 
 		 242 aa  217  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  49.76 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  51.64 
 
 		 236 aa  205  9e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  41.8 
 
 		 284 aa  202  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  39.67 
 
 		 290 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  47.71 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  40.82 
 
 		 253 aa  196  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  46.4 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0364  VacJ family lipoprotein  42.33 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  43.19 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1820  VacJ family lipoprotein  41.78 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0279  VacJ family lipoprotein  41.31 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1563  VacJ family lipoprotein  40.55 
 
 		 232 aa  159  8e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1374  VacJ family lipoprotein  40.95 
 
 		 232 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0532  VacJ family lipoprotein  41.92 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2301  surface lipoprotein-like  36.15 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000223311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  42.64 
 
 		 234 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  42.64 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  42.64 
 
 		 235 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  42.13 
 
 		 235 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  39.59 
 
 		 208 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  42.13 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  39.41 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  42.13 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  41.12 
 
 		 234 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_1005  VacJ family lipoprotein  37.38 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18106  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1281  conserved hypothetical protein, VacJ family  34.98 
 
 		 228 aa  142  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  39.59 
 
 		 271 aa  142  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  41.79 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  40.1 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  40.1 
 
 		 234 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  39.39 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  37.93 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  39.39 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  41.03 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  39.59 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  40.61 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  40.1 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1239  VacJ family lipoprotein  40.78 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  39.59 
 
 		 229 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  41.26 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  41.26 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  40.29 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  37.86 
 
 		 241 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  40.21 
 
 		 267 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  39.5 
 
 		 233 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  40 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  40.31 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  40 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  40.78 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  38.81 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  39.59 
 
 		 233 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  39.6 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  37.93 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  41.62 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  40.31 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  38.69 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  38.78 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  40.29 
 
 		 267 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  39.09 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  39.49 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  39.32 
 
 		 262 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  36.95 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  37.44 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  38.04 
 
 		 270 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  37.31 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  39.69 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  37.76 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  37.31 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4150  VacJ-like lipoprotein  35.98 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  37.31 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  37.31 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  37.62 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  40.78 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  40.29 
 
 		 270 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2690  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  40.84 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  36.82 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  37.24 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  36.82 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  36.82 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  36.82 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  37.62 
 
 		 248 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
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NC_003296  RS01688  lipoprotein  32.16 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  38.19 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
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NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  38.86 
 
 		 330 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  38.86 
 
 		 330 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  38.86 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  38.86 
 
 		 330 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  38.86 
 
 		 327 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  38.86 
 
 		 342 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  38.86 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  42.03 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
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