202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3199 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  50.24 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  48.74 
 
 
284 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  47.76 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  50.5 
 
 
290 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1820  VacJ family lipoprotein  37.98 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  46.27 
 
 
259 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  44.67 
 
 
233 aa  169  6e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0055  VacJ-like lipoprotein  37.26 
 
 
290 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.743056  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  41.46 
 
 
242 aa  165  5e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  43.15 
 
 
236 aa  163  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0532  VacJ family lipoprotein  42 
 
 
282 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  42.19 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  42.16 
 
 
259 aa  154  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  40.93 
 
 
230 aa  152  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  40.91 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  39.41 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2301  surface lipoprotein-like  40 
 
 
282 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000223311  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0364  VacJ family lipoprotein  39.59 
 
 
237 aa  142  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  38.46 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  42.79 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1005  VacJ family lipoprotein  35.84 
 
 
249 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  38.81 
 
 
241 aa  138  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  40.4 
 
 
269 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  38.01 
 
 
267 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1563  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 
232 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  43.01 
 
 
208 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  39.32 
 
 
290 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  36.44 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0279  VacJ family lipoprotein  38.61 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1374  VacJ family lipoprotein  35.51 
 
 
232 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  40 
 
 
283 aa  135  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  37.88 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  39.7 
 
 
291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  36.32 
 
 
295 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  38.89 
 
 
261 aa  131  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  35.65 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1281  conserved hypothetical protein, VacJ family  37.06 
 
 
228 aa  129  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  38 
 
 
277 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  40.4 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  39.52 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  36.79 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  37.56 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  38.86 
 
 
234 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  39.29 
 
 
249 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  35.39 
 
 
249 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  39.79 
 
 
338 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  39.09 
 
 
234 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2594  VacJ family lipoprotein  38.92 
 
 
270 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.123162  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  40.91 
 
 
259 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  36.93 
 
 
295 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  36.68 
 
 
252 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  32.66 
 
 
296 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  40.31 
 
 
340 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  33.64 
 
 
280 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2480  VacJ-like lipoprotein  35.78 
 
 
266 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.0468041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4150  VacJ-like lipoprotein  31.94 
 
 
296 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  37.81 
 
 
235 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  33.64 
 
 
279 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  36.45 
 
 
252 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  39.41 
 
 
250 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  39.41 
 
 
250 aa  122  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  38.34 
 
 
235 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  35.29 
 
 
260 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  40.31 
 
 
336 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  37.7 
 
 
284 aa  121  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  37.44 
 
 
329 aa  121  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  39.06 
 
 
234 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2690  hypothetical protein  36.45 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  38.31 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  37.5 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  37.5 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  37.44 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  37.31 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  39.06 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  36.82 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  35.08 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  35.68 
 
 
229 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  36.57 
 
 
317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  38.38 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  36.65 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0561  surface lipoprotein-like  35.23 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.361173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  36.5 
 
 
352 aa  119  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  39.53 
 
 
251 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  33.5 
 
 
232 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  37.17 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  36.13 
 
 
320 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  36.13 
 
 
320 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  36.13 
 
 
320 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  37.31 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  36.13 
 
 
321 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  36.13 
 
 
321 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
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NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  44.85 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal 
 
 
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NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  36.6 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  36.92 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  36.13 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
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