202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0561 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



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Replicon accession
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% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0561  surface lipoprotein-like  100 
 
 		 292 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.361173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4150  VacJ-like lipoprotein  41.41 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  45.95 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  36.05 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  37.5 
 
 		 255 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  42.86 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  37.91 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  36.23 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  35.75 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  35.75 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  35.75 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  35.27 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  35.27 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  35.64 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  40 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  42.95 
 
 		 253 aa  122  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  35.92 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  38.31 
 
 		 269 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  40.49 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  36 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  35.23 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  40.76 
 
 		 262 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  33.67 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  36.79 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  37.31 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  35.1 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  36.32 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  34.25 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  35.5 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  34.17 
 
 		 234 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  35.15 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  34.67 
 
 		 234 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  43.57 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  35.15 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  30.62 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  35.36 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  36.14 
 
 		 234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  43.57 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  35.15 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  35.15 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  35.82 
 
 		 235 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2363  VacJ family lipoprotein  32.78 
 
 		 262 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  35.02 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  38.61 
 
 		 337 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2690  hypothetical protein  42.07 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  40.14 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  38.46 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  37.65 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  36 
 
 		 233 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1855  VacJ family lipoprotein  30.33 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  41.5 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  36.76 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  34.33 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1374  VacJ family lipoprotein  43.85 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1563  VacJ family lipoprotein  43.85 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  34.65 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  34.65 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  31 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  37.81 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  36.14 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  34.31 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  34.65 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  42.75 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  34.65 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  43.36 
 
 		 338 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  38.26 
 
 		 230 aa  114  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  35.5 
 
 		 221 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  34.98 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  40.82 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  37.84 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  37.62 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  32.52 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  35.48 
 
 		 347 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  37.62 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  36.63 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  32.73 
 
 		 277 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  37.62 
 
 		 334 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  37.31 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  37.13 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  37.13 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  37.13 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  34.93 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  35.5 
 
 		 233 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  35.44 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2301  surface lipoprotein-like  40 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000223311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  32.88 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  42.45 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1820  VacJ family lipoprotein  37.02 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  39.31 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  38.22 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  36.81 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
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NC_009707  JJD26997_0279  VacJ family lipoprotein  42.31 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  36.32 
 
 		 330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  36.32 
 
 		 324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  36.32 
 
 		 327 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  36.32 
 
 		 330 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  36.32 
 
 		 330 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  36.32 
 
 		 342 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  36.32 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
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