202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1620 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  98.15 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  75.19 
 
 		 262 aa  411  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  67.15 
 
 		 274 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  66.3 
 
 		 270 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  74.47 
 
 		 267 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  72.84 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  72.84 
 
 		 275 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  72.84 
 
 		 274 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1239  VacJ family lipoprotein  65.93 
 
 		 256 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  68.26 
 
 		 257 aa  336  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  47.81 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  45.75 
 
 		 255 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0995  VacJ-like lipoprotein  45.41 
 
 		 747 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.4612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  44.39 
 
 		 251 aa  185  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2690  hypothetical protein  48.26 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1855  VacJ family lipoprotein  45.59 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2363  VacJ family lipoprotein  45.1 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  45.37 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2132  VacJ family lipoprotein  39.23 
 
 		 318 aa  161  9e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000157354  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  43.43 
 
 		 340 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  46.67 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  49.69 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  53.73 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  41.62 
 
 		 338 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  52.38 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  47.27 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  51.68 
 
 		 336 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  41.21 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  41.79 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  52.55 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  44.06 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  46.67 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  46.67 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  46.2 
 
 		 233 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  46.1 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  44.62 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  46.1 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  46.1 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  46.1 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  46.1 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  46.1 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  46.1 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  54.48 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  53.73 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  41.79 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  54.48 
 
 		 234 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  49.28 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  46.1 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  49.28 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  49.28 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  50 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  51.97 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  49.26 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  46.1 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  48.55 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  46.1 
 
 		 329 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  47.83 
 
 		 336 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  48.55 
 
 		 321 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  47.52 
 
 		 234 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  48.55 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  49.28 
 
 		 325 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  47.83 
 
 		 336 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  47.83 
 
 		 336 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  47.76 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  44.77 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  47.83 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  51.18 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  47.83 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  47.83 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  47.83 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  40.82 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  48.99 
 
 		 284 aa  142  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  47.83 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  50.37 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  48.53 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  49.63 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  50.37 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  45.45 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  44.16 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  44.16 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  45.45 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  43.03 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  45.45 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  52.55 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  48.89 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  42.42 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  49.63 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  51.15 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
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NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  48.34 
 
 		 230 aa  139  7e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  39.39 
 
 		 229 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  45.51 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  49.25 
 
 		 234 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  44.58 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  39.22 
 
 		 336 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
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NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  45.83 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
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NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  45.45 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  45.45 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  40.29 
 
 		 315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  47.55 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
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