202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2163 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



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Replicon accession
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Product
% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 235 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  98.72 
 
 		 235 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  97.02 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  95.32 
 
 		 235 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  75.32 
 
 		 233 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  75.32 
 
 		 233 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  79.02 
 
 		 229 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  70.21 
 
 		 234 aa  347  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  69.79 
 
 		 234 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  69.36 
 
 		 234 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  68.64 
 
 		 234 aa  334  7.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  66.18 
 
 		 208 aa  301  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  47.73 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  50.45 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  49.79 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  51.74 
 
 		 296 aa  211  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  49.52 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  45.89 
 
 		 347 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  48.53 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  47.58 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  45.7 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  41.84 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  43.53 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  46.19 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  46.19 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  46.19 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  45.71 
 
 		 325 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  45.07 
 
 		 277 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  45.71 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  45.71 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  45.24 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  46.86 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  44.84 
 
 		 277 aa  189  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  45 
 
 		 338 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  47.55 
 
 		 336 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  47.55 
 
 		 336 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  47.55 
 
 		 319 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  47 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  47.76 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  44.55 
 
 		 340 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  44.35 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  41.67 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  47.06 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  47.06 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  45.29 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  47.06 
 
 		 336 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  47.06 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  45.85 
 
 		 266 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  42.15 
 
 		 337 aa  185  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  44.55 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  43.06 
 
 		 329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  42.15 
 
 		 347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  41.7 
 
 		 334 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  43.24 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  42.15 
 
 		 347 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  45.54 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  41.7 
 
 		 334 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  42.15 
 
 		 347 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  43.17 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  42.92 
 
 		 342 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  42.92 
 
 		 310 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  42.92 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  43.19 
 
 		 271 aa  180  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  46.48 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  46.19 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  42.48 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  42.48 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  42.48 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  42.48 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  43.26 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  42.59 
 
 		 321 aa  178  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  45.1 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  43.33 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  44.61 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  44.61 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  43.64 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  46.84 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  38.89 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  42.16 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  43.42 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  43.48 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  43.48 
 
 		 248 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  44.95 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  42.51 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  38.24 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  41.06 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  39.27 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  42.71 
 
 		 295 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  38.81 
 
 		 260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  52.21 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1239  VacJ family lipoprotein  42.51 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  37.95 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  38.86 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  42.64 
 
 		 315 aa  148  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  37.32 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  35.57 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  39.3 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  41.71 
 
 		 266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0995  VacJ-like lipoprotein  35 
 
 		 747 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.4612 
 
 
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NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  49.26 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
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