202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2938 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  100 
 
 		 277 aa  566  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  59.74 
 
 		 248 aa  288  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  58.95 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  62.61 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  62.61 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  61.99 
 
 		 267 aa  268  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  61.46 
 
 		 266 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  61.84 
 
 		 260 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  55.83 
 
 		 281 aa  258  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  54.2 
 
 		 267 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  55.31 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  53.48 
 
 		 269 aa  249  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  52.54 
 
 		 303 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  49.57 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  46.84 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  46.91 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  46.26 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  46.26 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  46.26 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  46.19 
 
 		 347 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  45.21 
 
 		 347 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  45.21 
 
 		 347 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  47.09 
 
 		 241 aa  209  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  45.81 
 
 		 330 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  45.81 
 
 		 330 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  45.81 
 
 		 330 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  47.6 
 
 		 262 aa  208  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  45.81 
 
 		 327 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  49.76 
 
 		 283 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  45.16 
 
 		 329 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  45.71 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  50.22 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  45.95 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  46.09 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  43.84 
 
 		 334 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  42.86 
 
 		 334 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  48.85 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  46.7 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  47.83 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  49.51 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  49.51 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  49.51 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  45.61 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  45.61 
 
 		 336 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  49.03 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  49.03 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  43.8 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  49.03 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  48.54 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  46.9 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  44.78 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  47.06 
 
 		 319 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  45.18 
 
 		 336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  46.61 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  46.61 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  46.61 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  43.64 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  47.2 
 
 		 245 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  44.59 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  42.5 
 
 		 315 aa  191  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  45.29 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  46.12 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  44.84 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  44.78 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  47.29 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  45.93 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  44.35 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  45.16 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  45.85 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  43.44 
 
 		 347 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  43.56 
 
 		 229 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  43.75 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  44.14 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  44.78 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  40.77 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  40.77 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  45.79 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  36.69 
 
 		 284 aa  165  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  41.26 
 
 		 208 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  41.55 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  44.12 
 
 		 220 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  38.77 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  38.56 
 
 		 234 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  43.41 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  44.1 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  40.2 
 
 		 301 aa  148  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  36.51 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  42.35 
 
 		 295 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  40.08 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  39.2 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  40.48 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  40.48 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  42.42 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  40.48 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  41.92 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  41.78 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  41.26 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  41.75 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  39.25 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  36.18 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>