202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4134 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
336 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  62.04 
 
 
338 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  65.02 
 
 
340 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  62.13 
 
 
321 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  60.2 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  58.8 
 
 
347 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  58.75 
 
 
347 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  58.75 
 
 
347 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  69.96 
 
 
330 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  69.96 
 
 
330 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  69.96 
 
 
342 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  69.96 
 
 
310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  69.83 
 
 
330 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  69.83 
 
 
327 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  69.83 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  66.95 
 
 
337 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  57.62 
 
 
334 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  65.68 
 
 
334 aa  325  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  65.18 
 
 
277 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  57.5 
 
 
291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  53.59 
 
 
315 aa  255  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  52.92 
 
 
267 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  52.5 
 
 
267 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  54.08 
 
 
347 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  53.85 
 
 
340 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  51.8 
 
 
336 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  50 
 
 
269 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  51.8 
 
 
319 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  51.8 
 
 
336 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  51.35 
 
 
336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  51.35 
 
 
311 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  51.35 
 
 
319 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  51.35 
 
 
319 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  51.35 
 
 
319 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  53.53 
 
 
325 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  53.24 
 
 
260 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  50.95 
 
 
266 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  50.65 
 
 
318 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  50.65 
 
 
320 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  50.65 
 
 
320 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  50.65 
 
 
320 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  50.22 
 
 
321 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  51.2 
 
 
261 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  50.22 
 
 
321 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  52.19 
 
 
303 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  54.46 
 
 
250 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  54.46 
 
 
250 aa  229  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  48.92 
 
 
267 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  49.58 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  45.76 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  47.35 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  46.19 
 
 
277 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  43.61 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  43.4 
 
 
284 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  48.8 
 
 
271 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  43.56 
 
 
245 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  46.82 
 
 
263 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  45.75 
 
 
290 aa  192  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  45.61 
 
 
283 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  45.7 
 
 
249 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  46.12 
 
 
262 aa  186  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  40.65 
 
 
260 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  47.26 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  44.91 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  41.42 
 
 
249 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  44.44 
 
 
234 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  48.69 
 
 
234 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  44.44 
 
 
234 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  40.93 
 
 
296 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  42.38 
 
 
241 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  43.17 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  44.86 
 
 
235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  44.86 
 
 
235 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  46.84 
 
 
235 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  43.26 
 
 
235 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  41.99 
 
 
261 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  41.67 
 
 
352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  42.25 
 
 
233 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  40 
 
 
260 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  43.98 
 
 
208 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  39.56 
 
 
260 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  43.94 
 
 
220 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  41.31 
 
 
233 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  42.27 
 
 
336 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  45.79 
 
 
234 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  44.44 
 
 
274 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  43.94 
 
 
275 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  45.18 
 
 
274 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  43.46 
 
 
229 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  41.4 
 
 
315 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  43.94 
 
 
248 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  44.67 
 
 
270 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  40.79 
 
 
317 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  37.13 
 
 
279 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  37.13 
 
 
280 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  41.18 
 
 
301 aa  149  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1154  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 
273 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  45.13 
 
 
290 aa  149  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  44.16 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  37.17 
 
 
232 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
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