202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1772 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
280 aa  568  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  100 
 
 
279 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  40.4 
 
 
315 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  43.81 
 
 
347 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  43.23 
 
 
291 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  43.78 
 
 
340 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  41.95 
 
 
311 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  42.49 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  40.93 
 
 
336 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  40.93 
 
 
336 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  40.93 
 
 
319 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  42.06 
 
 
320 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  42.06 
 
 
320 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  42.06 
 
 
320 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  41.63 
 
 
321 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  41.63 
 
 
321 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  40.51 
 
 
319 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  40.51 
 
 
319 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  40.51 
 
 
336 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  40.51 
 
 
319 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  37.74 
 
 
267 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  41.2 
 
 
318 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  37.36 
 
 
267 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  40.85 
 
 
261 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  41.74 
 
 
277 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  40.76 
 
 
252 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  38.2 
 
 
269 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  39.19 
 
 
269 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  39.47 
 
 
249 aa  159  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  40 
 
 
303 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  39.92 
 
 
284 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  37.99 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  39.41 
 
 
266 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  39.45 
 
 
281 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  37.45 
 
 
336 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  37.9 
 
 
260 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  37.61 
 
 
263 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  37.9 
 
 
260 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  37.93 
 
 
234 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  40.93 
 
 
340 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  37.93 
 
 
234 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  40 
 
 
338 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  36.92 
 
 
283 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  36.87 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  39.11 
 
 
220 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  36.82 
 
 
260 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  39.71 
 
 
250 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  34.03 
 
 
235 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  36.4 
 
 
329 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  39.22 
 
 
250 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  46.5 
 
 
267 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  35.29 
 
 
266 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  35.34 
 
 
245 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  35.84 
 
 
337 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  29.55 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  35.42 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  35.42 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  35.42 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  33.19 
 
 
235 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  35.64 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  35.32 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  34.98 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  35.32 
 
 
336 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  35.1 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  35.71 
 
 
334 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  35.98 
 
 
334 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  35.27 
 
 
208 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  36.82 
 
 
234 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  35.48 
 
 
235 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  36.16 
 
 
324 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  35.44 
 
 
342 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  35.44 
 
 
310 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  36.28 
 
 
330 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  34.53 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  35.74 
 
 
321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  38.73 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  36.28 
 
 
330 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  37.09 
 
 
330 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  35.1 
 
 
258 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  37.09 
 
 
327 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  35.62 
 
 
262 aa  136  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1563  VacJ family lipoprotein  38.34 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  35.83 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  35.64 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1374  VacJ family lipoprotein  37.82 
 
 
232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  34.33 
 
 
255 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1281  conserved hypothetical protein, VacJ family  37.95 
 
 
228 aa  132  5e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  34.22 
 
 
259 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  39.38 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  38.14 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  36.68 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0279  VacJ family lipoprotein  36.79 
 
 
236 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  33.18 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  35.21 
 
 
259 aa  129  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  37.24 
 
 
284 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  34.52 
 
 
301 aa  128  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  34.76 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  31.11 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  39.7 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  35.82 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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