202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3002 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
253 aa  519  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  48.71 
 
 
284 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  50.5 
 
 
290 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  47.76 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  44.04 
 
 
259 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  45.69 
 
 
315 aa  191  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  41.99 
 
 
242 aa  180  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1820  VacJ family lipoprotein  40.6 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2301  surface lipoprotein-like  40.34 
 
 
282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000223311  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  41.82 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  44.16 
 
 
233 aa  167  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  41.63 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  41.4 
 
 
230 aa  163  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0364  VacJ family lipoprotein  41.38 
 
 
237 aa  155  6e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  40.98 
 
 
295 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  40.21 
 
 
271 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0532  VacJ family lipoprotein  39.3 
 
 
282 aa  148  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  41.75 
 
 
234 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1374  VacJ family lipoprotein  39.35 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1563  VacJ family lipoprotein  39.9 
 
 
232 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  36.36 
 
 
296 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  42.19 
 
 
283 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  40.5 
 
 
315 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4150  VacJ-like lipoprotein  35.29 
 
 
296 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0279  VacJ family lipoprotein  38.14 
 
 
236 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  41.75 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  40.89 
 
 
234 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  40.93 
 
 
208 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0055  VacJ-like lipoprotein  37.13 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.743056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  41.67 
 
 
258 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  38.07 
 
 
267 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  40.84 
 
 
336 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  40.84 
 
 
336 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  40.51 
 
 
319 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  40.51 
 
 
311 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  40.84 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  40.1 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  38.54 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  37.38 
 
 
317 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  39.79 
 
 
318 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  40.31 
 
 
336 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  40 
 
 
319 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  40 
 
 
319 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  40 
 
 
319 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  40.72 
 
 
340 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  39.79 
 
 
325 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  39.27 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  39.27 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  39.27 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  39.39 
 
 
277 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  39.27 
 
 
321 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  39.27 
 
 
321 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  38.14 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  38.14 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  39.27 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  39.27 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1281  conserved hypothetical protein, VacJ family  35.64 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1005  VacJ family lipoprotein  33.8 
 
 
249 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  37.76 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  39.09 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  39.59 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  37.24 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  38.94 
 
 
295 aa  128  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  35.6 
 
 
269 aa  128  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  34.58 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  39.9 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  38.12 
 
 
301 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  37.88 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  37.37 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  38.12 
 
 
233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  36.55 
 
 
352 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  37.5 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  38.81 
 
 
259 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 
235 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  37.62 
 
 
233 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  38.78 
 
 
338 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 
235 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  37.88 
 
 
235 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  38.78 
 
 
340 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  39.27 
 
 
336 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 
235 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  38.78 
 
 
266 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  35.55 
 
 
315 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0561  surface lipoprotein-like  42.95 
 
 
292 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.361173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  41.14 
 
 
251 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  46.62 
 
 
296 aa  121  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  36.46 
 
 
281 aa  121  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  37.24 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  38.22 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  38.22 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 
260 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  36.98 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  34.98 
 
 
229 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
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NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  35.87 
 
 
252 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2594  VacJ family lipoprotein  32.2 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.123162  normal 
 
 
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NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  35.86 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  38.02 
 
 
334 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
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NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  35.86 
 
 
220 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
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NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  40.1 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  38.02 
 
 
334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
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