202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0450 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



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Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  100 
 
 
290 aa  594  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  48.83 
 
 
284 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  47.96 
 
 
253 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  47.55 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  50.5 
 
 
254 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  49.49 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  48.48 
 
 
236 aa  186  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  44.55 
 
 
242 aa  186  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  45.12 
 
 
259 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  37.92 
 
 
259 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2301  surface lipoprotein-like  38.83 
 
 
282 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000223311  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  42.58 
 
 
230 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1820  VacJ family lipoprotein  42.45 
 
 
273 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0532  VacJ family lipoprotein  44.78 
 
 
282 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  48 
 
 
241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  46.27 
 
 
347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  46.91 
 
 
315 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  44.5 
 
 
340 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4150  VacJ-like lipoprotein  41.33 
 
 
296 aa  158  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0364  VacJ family lipoprotein  41.79 
 
 
237 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  47.69 
 
 
267 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  47.69 
 
 
267 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  44.27 
 
 
291 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  44.88 
 
 
336 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  44.88 
 
 
336 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  44.88 
 
 
319 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  44.88 
 
 
311 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  44.39 
 
 
336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  44.39 
 
 
319 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  44.39 
 
 
319 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  44.39 
 
 
338 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  43.94 
 
 
234 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  44.39 
 
 
319 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  44.44 
 
 
234 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  43.43 
 
 
234 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  43.07 
 
 
295 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  44.39 
 
 
340 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  43.28 
 
 
320 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  43.28 
 
 
320 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  43.28 
 
 
320 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  42.79 
 
 
318 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  46.15 
 
 
269 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  44.04 
 
 
337 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  42.51 
 
 
325 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  42.79 
 
 
321 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  42.79 
 
 
321 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  44.04 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  45.13 
 
 
336 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  46.5 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  43.46 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  43.84 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  43.52 
 
 
347 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  43.52 
 
 
347 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  43.52 
 
 
347 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  43.01 
 
 
334 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  43.01 
 
 
334 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  43.08 
 
 
330 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  43.08 
 
 
330 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  39.9 
 
 
208 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  43.08 
 
 
330 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  43.08 
 
 
327 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  43.08 
 
 
324 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  43.08 
 
 
342 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  43.08 
 
 
310 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  43.01 
 
 
245 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0561  surface lipoprotein-like  45.95 
 
 
292 aa  142  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.361173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  43.08 
 
 
321 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  41.4 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  40.91 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0055  VacJ-like lipoprotein  40.2 
 
 
290 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.743056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  39.72 
 
 
258 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  43.75 
 
 
249 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  39.2 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  38.84 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  40.91 
 
 
235 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  40.91 
 
 
235 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1005  VacJ family lipoprotein  39.69 
 
 
249 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  40.82 
 
 
263 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  39.29 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  38.14 
 
 
295 aa  136  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  40.4 
 
 
235 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1239  VacJ family lipoprotein  35.71 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2690  hypothetical protein  49.28 
 
 
254 aa  135  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  40.3 
 
 
261 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  39.7 
 
 
261 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  38.46 
 
 
252 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  41.38 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  39.23 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  44.52 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  39.23 
 
 
270 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  39.9 
 
 
229 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  37.38 
 
 
234 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1374  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 
232 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003296  RS01688  lipoprotein  37.13 
 
 
296 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  40.72 
 
 
317 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1281  conserved hypothetical protein, VacJ family  38.65 
 
 
228 aa  132  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1563  VacJ family lipoprotein  36.82 
 
 
232 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  40.32 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
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NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  40.8 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  39.38 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal 
 
 
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