202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1005 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1005  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18106  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2301  surface lipoprotein-like  39.35 
 
 
282 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000223311  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  33.46 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  37.7 
 
 
315 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  35.84 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  39.69 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  32.92 
 
 
315 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  33.8 
 
 
284 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  32.68 
 
 
259 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  32.64 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  37.17 
 
 
340 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  35.9 
 
 
269 aa  131  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  32.08 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1820  VacJ family lipoprotein  31.38 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  36.65 
 
 
347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  36.65 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  36.04 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  33.75 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  39.79 
 
 
234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  37.7 
 
 
325 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  35.47 
 
 
315 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  34.65 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2132  VacJ family lipoprotein  44.2 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000157354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  36.6 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  36.65 
 
 
318 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  36.08 
 
 
336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  36.08 
 
 
336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  36.08 
 
 
319 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  36.13 
 
 
235 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  33.77 
 
 
235 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  36.08 
 
 
336 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  36.13 
 
 
320 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  35.57 
 
 
250 aa  125  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  36.13 
 
 
320 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  35.57 
 
 
250 aa  125  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  36.13 
 
 
320 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  37.7 
 
 
234 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  35.6 
 
 
235 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  36.13 
 
 
321 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  36.08 
 
 
319 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  36.08 
 
 
319 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  36.13 
 
 
321 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  36.08 
 
 
319 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  31.67 
 
 
269 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  34.55 
 
 
263 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  38.22 
 
 
234 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0364  VacJ family lipoprotein  33.96 
 
 
237 aa  123  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  37.17 
 
 
208 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  36.13 
 
 
260 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  33.64 
 
 
233 aa  122  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  36.92 
 
 
262 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  32.65 
 
 
284 aa  122  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  32.08 
 
 
267 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  35.6 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  34.02 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  31.4 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  29.77 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  34.55 
 
 
233 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  33.68 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  35.42 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  31.25 
 
 
267 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  32.84 
 
 
266 aa  118  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  31.41 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  35.68 
 
 
229 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  34.6 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0532  VacJ family lipoprotein  34.2 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  34.55 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  37.31 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1374  VacJ family lipoprotein  33.49 
 
 
232 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  31.95 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  35.42 
 
 
283 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1563  VacJ family lipoprotein  33.02 
 
 
232 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  34.06 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  36.98 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  36.55 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0055  VacJ-like lipoprotein  31.8 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.743056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  33.51 
 
 
248 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  35.08 
 
 
340 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  32.67 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2480  VacJ-like lipoprotein  36.22 
 
 
266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.0468041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  34.38 
 
 
234 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  35.08 
 
 
338 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  41.67 
 
 
295 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  32.58 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  32.99 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  32.99 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  42.76 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  32.99 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  30.49 
 
 
334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  32.99 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  32.99 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  32.99 
 
 
342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  32.99 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  30.08 
 
 
347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
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NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  32.99 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  30.49 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
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NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  30.08 
 
 
347 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  42.11 
 
 
274 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  30.08 
 
 
347 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
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NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  31.94 
 
 
281 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
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