202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01688 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01688  lipoprotein  100 
 
 		 296 aa  609  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  48.47 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  47.96 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  44.13 
 
 		 350 aa  195  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  44.13 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  43.3 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  41.05 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  40.2 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  40.21 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  42.05 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  39.17 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  40 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  42.05 
 
 		 347 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  39.9 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  38.78 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  39.27 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  39.69 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  36.76 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  36.27 
 
 		 235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  39.5 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  35.57 
 
 		 235 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  37.11 
 
 		 234 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  35.57 
 
 		 235 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  35.57 
 
 		 235 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  38.5 
 
 		 296 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  39.69 
 
 		 338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  38.86 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  38.86 
 
 		 234 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  38.46 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  39.69 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  39.49 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  39.49 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  39.49 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  40.53 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  35.57 
 
 		 233 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  35.23 
 
 		 229 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  39.49 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  39.49 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  37.69 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  37.69 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  38.97 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  37.69 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  36.98 
 
 		 208 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  38.58 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  35.23 
 
 		 233 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
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NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  34.58 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  41.05 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  38.27 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  35.48 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  38.27 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  37.38 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  36.71 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  35.82 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  35.91 
 
 		 245 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  33.71 
 
 		 284 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  33.8 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  37.44 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  37.88 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  38.14 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  35.05 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  38.81 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  36.92 
 
 		 260 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  37.7 
 
 		 336 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  37.7 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  37.7 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  37.7 
 
 		 336 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0220  VacJ family lipoprotein  36.68 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  35.27 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  37.56 
 
 		 260 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1563  VacJ family lipoprotein  38.31 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0891  putative lipoprotein  37.31 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.363654  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  34.17 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  37.17 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  37.17 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  37.17 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  38.95 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  37.17 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  36.32 
 
 		 252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1374  VacJ family lipoprotein  38.31 
 
 		 232 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2550  VacJ family lipoprotein  36.82 
 
 		 262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  37 
 
 		 249 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  36.79 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  38.46 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  37.13 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  36.6 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2035  VacJ family lipoprotein  38.28 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  35.6 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  34.7 
 
 		 281 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  34.29 
 
 		 259 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  38.97 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
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NC_009707  JJD26997_0279  VacJ family lipoprotein  36.55 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  33.8 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0116  VacJ family lipoprotein  35.82 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211994  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  32.16 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  36.14 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  35.9 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  34.84 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  34.36 
 
 		 347 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
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NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  34.36 
 
 		 347 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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