202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4558 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
347 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  98.27 
 
 
347 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  98.27 
 
 
347 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  90.91 
 
 
329 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  89.63 
 
 
334 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  83.71 
 
 
337 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  87.32 
 
 
334 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  75.78 
 
 
321 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  72.11 
 
 
330 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  72.11 
 
 
330 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  72.45 
 
 
342 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  72.45 
 
 
310 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  72.16 
 
 
324 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  71.82 
 
 
330 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  71.82 
 
 
327 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  59.37 
 
 
338 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  61.69 
 
 
340 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  57.79 
 
 
336 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  55.1 
 
 
291 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  58.56 
 
 
277 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  51.33 
 
 
325 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  54.78 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  54.35 
 
 
321 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  50.43 
 
 
347 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  53.48 
 
 
320 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  53.48 
 
 
320 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  48.09 
 
 
315 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  50.38 
 
 
321 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  53.48 
 
 
320 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  51.54 
 
 
267 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  51.13 
 
 
267 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  51.42 
 
 
260 aa  236  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  51.9 
 
 
303 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  50.67 
 
 
269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  51.47 
 
 
266 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  50.91 
 
 
340 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  51.21 
 
 
250 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  51.21 
 
 
250 aa  229  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  47.77 
 
 
311 aa  228  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  47.58 
 
 
336 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  47.58 
 
 
336 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  47.58 
 
 
319 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  46.77 
 
 
336 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  45.49 
 
 
319 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  45.49 
 
 
319 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  49.79 
 
 
266 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  45.49 
 
 
319 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  47.09 
 
 
281 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  46.82 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  48.53 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  47.42 
 
 
267 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  46.19 
 
 
277 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  45.87 
 
 
245 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  46.26 
 
 
263 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  48.57 
 
 
271 aa  202  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  39.75 
 
 
269 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  44.96 
 
 
283 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  42.33 
 
 
290 aa  193  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  43.23 
 
 
252 aa  193  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  44.39 
 
 
249 aa  190  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  42.21 
 
 
284 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  43.05 
 
 
235 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  45.29 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  42.11 
 
 
241 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  41.7 
 
 
235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  45.45 
 
 
234 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  41.92 
 
 
258 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  44.95 
 
 
234 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  43.78 
 
 
234 aa  179  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  42.15 
 
 
235 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  41.9 
 
 
296 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  40.36 
 
 
235 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  45.36 
 
 
234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  39.66 
 
 
249 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  42.21 
 
 
233 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  41.97 
 
 
208 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  41.71 
 
 
233 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  38.46 
 
 
260 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  38.3 
 
 
352 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  41.92 
 
 
295 aa  162  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  40.62 
 
 
260 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  40.36 
 
 
260 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  40.85 
 
 
261 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  39.45 
 
 
229 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  43.68 
 
 
336 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  38.67 
 
 
315 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  41.29 
 
 
274 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  43.52 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  39.51 
 
 
220 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  37.56 
 
 
232 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  37.5 
 
 
249 aa  147  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  40.3 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  41 
 
 
248 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  41 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1154  VacJ family lipoprotein  38.91 
 
 
273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0055  VacJ-like lipoprotein  36.97 
 
 
250 aa  142  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  45.45 
 
 
270 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  45.45 
 
 
270 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  38 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  39.7 
 
 
301 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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