202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0532 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0532  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1820  VacJ family lipoprotein  48.95 
 
 		 273 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  45.95 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2301  surface lipoprotein-like  46.95 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000223311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  38.81 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  37.24 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  40.28 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  40.83 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  42 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  41.92 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  37.04 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  38.32 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  39.3 
 
 		 253 aa  149  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0364  VacJ family lipoprotein  37.38 
 
 		 237 aa  138  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0055  VacJ-like lipoprotein  36.54 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.743056  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  42.36 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  38.54 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  38.78 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  37.07 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1281  conserved hypothetical protein, VacJ family  31.17 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  40.3 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  40.3 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  38 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  38 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  37 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  37 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  38 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  37 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  36.63 
 
 		 208 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  38 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  38 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  38 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  38 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  37.76 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  37.24 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  37.76 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  40.31 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  37.76 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  37.81 
 
 		 321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1005  VacJ family lipoprotein  33.66 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18106  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  36.41 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  37.5 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
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NC_003912  CJE1563  VacJ family lipoprotein  36.62 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  37.44 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  35.12 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  37.06 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  35.15 
 
 		 234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  39.11 
 
 		 234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1374  VacJ family lipoprotein  34.39 
 
 		 232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  35.64 
 
 		 234 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  36.92 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009707  JJD26997_0279  VacJ family lipoprotein  35.68 
 
 		 236 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  36.84 
 
 		 259 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  36.18 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  36.18 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  36.18 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  37.44 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  35.82 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  35.82 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  35.82 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  33.5 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  38.42 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  36.36 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  34.67 
 
 		 325 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  36.45 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  34.69 
 
 		 340 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  36.45 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  38.31 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  34.63 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  36.63 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  34.63 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  36.63 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  38.5 
 
 		 255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  36.1 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  36.97 
 
 		 249 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  36.63 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  34.63 
 
 		 235 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  33.85 
 
 		 347 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  34.17 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  34.15 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  34.17 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  34.85 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  34.17 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  34.17 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0561  surface lipoprotein-like  30.38 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.361173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  35.75 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  34.34 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  34.98 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  35.18 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  33.67 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  36.02 
 
 		 252 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  33.67 
 
 		 319 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  34.33 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  33.67 
 
 		 319 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  37.69 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  33.67 
 
 		 319 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_0140  VacJ family lipoprotein  33.17 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  36 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
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