202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0140 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0140  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 273 aa  554  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_0891  putative lipoprotein  50 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.363654  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2550  VacJ family lipoprotein  49.57 
 
 		 262 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0116  VacJ family lipoprotein  45.8 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2480  VacJ-like lipoprotein  40.32 
 
 		 266 aa  185  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.0468041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2035  VacJ family lipoprotein  42.4 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  39.27 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  36.82 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  34.78 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  39.32 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  40.09 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  38.57 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  34.63 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  35.21 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  36.87 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  35.12 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  36.41 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  34.8 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  36.24 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  37.24 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  36.87 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  36.07 
 
 		 340 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  35.24 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  38.33 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  34.74 
 
 		 271 aa  135  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  37.31 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  35.06 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  35.06 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  34.35 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1970  VacJ family lipoprotein  36.54 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  0.0740313 
 
 
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NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  35.71 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  32.2 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  34.7 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  36.78 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  36.21 
 
 		 234 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  35.82 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  36.21 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  39.77 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  33.33 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  32.57 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  34.62 
 
 		 324 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  34.45 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 342 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  35.24 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
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NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  32.06 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
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NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  33.33 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
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NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  35.51 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
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NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  34.09 
 
 		 350 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  35.48 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  33.93 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  33.61 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  35.48 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  35.48 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  32.42 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
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NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  35.48 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  33.9 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  34.88 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  34.32 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  35.02 
 
 		 336 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  35.02 
 
 		 319 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  35.02 
 
 		 336 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  34.32 
 
 		 235 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  34.75 
 
 		 235 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  32.91 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  31.09 
 
 		 347 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  35.44 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  35.35 
 
 		 352 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  33.03 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  31.09 
 
 		 347 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  31.09 
 
 		 347 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  34.56 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  34.56 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  32.35 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  34.56 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  31.19 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  34.56 
 
 		 336 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  33 
 
 		 296 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  35.27 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  34.32 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  35.22 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  33.62 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  33.62 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  33.62 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0055  VacJ-like lipoprotein  36.22 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  34.85 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  33.19 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  32 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  33.47 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  37.09 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  32.75 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  33.5 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  33.62 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  33.47 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  32.75 
 
 		 321 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  35.65 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  31.73 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  31.47 
 
 		 241 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  36.23 
 
 		 220 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  36.62 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
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