202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3256 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  100 
 
 		 266 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  73.04 
 
 		 303 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  61.67 
 
 		 267 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  63.56 
 
 		 269 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  61.25 
 
 		 267 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  59.47 
 
 		 277 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  52.59 
 
 		 291 aa  254  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  55.77 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  52.23 
 
 		 315 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  53.33 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  53.4 
 
 		 266 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  53.51 
 
 		 340 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  50 
 
 		 347 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  50 
 
 		 347 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  50 
 
 		 347 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  53.81 
 
 		 329 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  50 
 
 		 277 aa  235  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  53.36 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  49.78 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  52.75 
 
 		 338 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  52.91 
 
 		 334 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  51.54 
 
 		 337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  53.21 
 
 		 340 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  56.04 
 
 		 336 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  56.04 
 
 		 336 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  53.88 
 
 		 325 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  53.57 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  56.04 
 
 		 319 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  54.76 
 
 		 320 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  54.76 
 
 		 320 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  54.76 
 
 		 320 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  50.88 
 
 		 250 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  51.82 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  54.29 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  54.29 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  53.81 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  49.58 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  55.07 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  50.65 
 
 		 342 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  50.65 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  55.07 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  55.07 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  55.07 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  51.1 
 
 		 324 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  50.21 
 
 		 336 aa  228  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  47.19 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  50.22 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  50.66 
 
 		 330 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  50.43 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  50.22 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  50.66 
 
 		 327 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  51.93 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  51.33 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  45.6 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  47.04 
 
 		 249 aa  215  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  48.11 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  45.45 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  48.71 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  47.81 
 
 		 241 aa  208  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  46.06 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  45.41 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  47.16 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  48.02 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  45.07 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  44.54 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  44.44 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  47.58 
 
 		 234 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  43.67 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  44.1 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  48.13 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  44.44 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  44.05 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  45.11 
 
 		 234 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  43.17 
 
 		 233 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  46.34 
 
 		 208 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  46.27 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  42.98 
 
 		 233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  42.99 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  42.04 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  40.93 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  45.1 
 
 		 232 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  42.79 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  41.26 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  40.71 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  40.71 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  37.94 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  40.26 
 
 		 253 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  45.1 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  40.2 
 
 		 296 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  41.24 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  38.7 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  42.86 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  38.1 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  39.15 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  39.5 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  36.44 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  41.62 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  36.44 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  37.02 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
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