202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2826 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 253 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  95.26 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1336  VacJ family lipoprotein  81.42 
 
 		 253 aa  427  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.134881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  77.87 
 
 		 253 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3382  VacJ family lipoprotein  75.7 
 
 		 252 aa  404  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1505  VacJ family lipoprotein  74.7 
 
 		 254 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0216408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1396  lipoprotein VacJ  74.7 
 
 		 254 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0386  VacJ lipoprotein  74.7 
 
 		 254 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2532  lipoprotein, VacJ family  72.11 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2635  VacJ family lipoprotein  72.11 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.0000000000141324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2746  lipoprotein, VacJ family  72.11 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0633065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2581  lipoprotein VacJ family  72.11 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2621  lipoprotein, VacJ family  72.11 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447032  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02272  predicted lipoprotein  71.31 
 
 		 251 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1311  VacJ family lipoprotein  70.92 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.561225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2497  VacJ family lipoprotein  71.31 
 
 		 251 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2642  VacJ family lipoprotein  71.31 
 
 		 251 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02233  hypothetical protein  71.31 
 
 		 251 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1307  VacJ family lipoprotein  71.31 
 
 		 251 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2505  VacJ family lipoprotein  71.31 
 
 		 251 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2729  lipoprotein, VacJ family  71.31 
 
 		 251 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3490  lipoprotein, VacJ family  71.31 
 
 		 251 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  70.92 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2272  lipoprotein VacJ precursor  50.44 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00759989  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  46.15 
 
 		 249 aa  226  4e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  50.22 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03126  hypothetical protein  43.82 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002850  surface lipoprotein VacJ  48.62 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  40.56 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  41.82 
 
 		 282 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  40.91 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  40.91 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1395  VacJ family lipoprotein  41.36 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0967319  normal  0.304519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  40.34 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  43.69 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  40.45 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  39.55 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  40.45 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  40.45 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  40.45 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  37.16 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  40.91 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  40.91 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  40.45 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  42.29 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  34.73 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  40.2 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  38.28 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  34.27 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  37.77 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  36.87 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  38.16 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  36.25 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  37.23 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  35.06 
 
 		 337 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  34.89 
 
 		 303 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  33.33 
 
 		 347 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  33.33 
 
 		 347 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  33.33 
 
 		 347 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  37.04 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  38.14 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  34.75 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  38.84 
 
 		 249 aa  131  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  36.71 
 
 		 267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  36.51 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  38.68 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  32.91 
 
 		 334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  32.77 
 
 		 334 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  36.77 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  39.34 
 
 		 301 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  36.48 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  37.5 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 		 325 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  35.35 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  37.89 
 
 		 340 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  32.6 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  34.4 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  38.97 
 
 		 336 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  38.97 
 
 		 336 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  38.97 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  37.04 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  38.6 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  37.04 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  36.57 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  33.92 
 
 		 277 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  38.5 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  38.5 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  37.2 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  34.72 
 
 		 338 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  38.5 
 
 		 336 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  38.5 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  34.65 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
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NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  35.27 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
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NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  34.31 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  35.27 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  34.98 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  33.04 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
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