202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2272 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2272  lipoprotein VacJ precursor  100 
 
 		 261 aa  531  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00759989  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03126  hypothetical protein  62.74 
 
 		 263 aa  332  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002850  surface lipoprotein VacJ  64.71 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  59.92 
 
 		 254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  50.87 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3382  VacJ family lipoprotein  46.77 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  50.44 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1336  VacJ family lipoprotein  47.24 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.134881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  46.85 
 
 		 253 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1505  VacJ family lipoprotein  50.23 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0216408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1396  lipoprotein VacJ  50.23 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0386  VacJ lipoprotein  50.23 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  44.27 
 
 		 259 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02272  predicted lipoprotein  47.37 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2497  VacJ family lipoprotein  47.37 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2505  VacJ family lipoprotein  47.37 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3490  lipoprotein, VacJ family  47.37 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02233  hypothetical protein  47.37 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1307  VacJ family lipoprotein  47.37 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2642  VacJ family lipoprotein  47.37 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2729  lipoprotein, VacJ family  47.37 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1311  VacJ family lipoprotein  46.93 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.561225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2746  lipoprotein, VacJ family  47.96 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0633065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2635  VacJ family lipoprotein  47.96 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.0000000000141324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2581  lipoprotein VacJ family  47.96 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2532  lipoprotein, VacJ family  47.96 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2621  lipoprotein, VacJ family  47.96 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  42.25 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  45.61 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  46.78 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  48.42 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  41.83 
 
 		 276 aa  208  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  45.73 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  45.73 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  44.21 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  44.21 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  44.63 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  44.63 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1395  VacJ family lipoprotein  41.54 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0967319  normal  0.304519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  45.3 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  40.61 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  43.31 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  45.98 
 
 		 321 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  48.37 
 
 		 249 aa  199  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  40.39 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  42.11 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  34.57 
 
 		 304 aa  161  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  37.35 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  35.07 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  35.71 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  39.07 
 
 		 315 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  44.19 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  36.17 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  38.39 
 
 		 352 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  36.29 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  35.89 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  38.35 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  35.74 
 
 		 281 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  35.81 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  37.19 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  36.22 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  35.71 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  34.63 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  34.93 
 
 		 234 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  36.8 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  31.5 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  38.97 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  38.97 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  35.35 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  35.78 
 
 		 347 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  39.7 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  33 
 
 		 208 aa  118  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  36.67 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  31.06 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  38.58 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  35.62 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  33.72 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  32.91 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  35.2 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  37.56 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  35.53 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  38.12 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  38.12 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  33.97 
 
 		 233 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  37.76 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  33.77 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  35.68 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  35.68 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  35.68 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  34.69 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  32.39 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0140  VacJ family lipoprotein  34.15 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  34.85 
 
 		 325 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  33.64 
 
 		 336 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  32.13 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  32.38 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  35.21 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  35.21 
 
 		 321 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>