202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002850 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002850  surface lipoprotein VacJ  100 
 
 
257 aa  528  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03126  hypothetical protein  85.21 
 
 
263 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  70.09 
 
 
254 aa  350  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2272  lipoprotein VacJ precursor  60.38 
 
 
261 aa  324  8.000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00759989  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  49.56 
 
 
253 aa  225  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3382  VacJ family lipoprotein  47.11 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  47.81 
 
 
253 aa  214  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1505  VacJ family lipoprotein  45.68 
 
 
254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0216408  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0386  VacJ lipoprotein  45.68 
 
 
254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1396  lipoprotein VacJ  45.68 
 
 
254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  46.4 
 
 
253 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1336  VacJ family lipoprotein  46.93 
 
 
253 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.134881  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  40.23 
 
 
255 aa  205  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  42.02 
 
 
260 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  41.34 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  39.76 
 
 
276 aa  199  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1395  VacJ family lipoprotein  39.08 
 
 
260 aa  198  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0967319  normal  0.304519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  41.74 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  41.74 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  42.53 
 
 
282 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  40.08 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  41.74 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  42.6 
 
 
261 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  42.27 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  42.73 
 
 
261 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  41.82 
 
 
261 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2635  VacJ family lipoprotein  44.16 
 
 
251 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.0000000000141324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2581  lipoprotein VacJ family  44.16 
 
 
251 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134529  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  43.26 
 
 
321 aa  190  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2621  lipoprotein, VacJ family  44.16 
 
 
251 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447032  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2532  lipoprotein, VacJ family  44.16 
 
 
251 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2746  lipoprotein, VacJ family  44.16 
 
 
251 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0633065  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02272  predicted lipoprotein  42.45 
 
 
251 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1307  VacJ family lipoprotein  42.45 
 
 
251 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2642  VacJ family lipoprotein  42.45 
 
 
251 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2505  VacJ family lipoprotein  42.45 
 
 
251 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2497  VacJ family lipoprotein  42.45 
 
 
251 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  42.08 
 
 
259 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3490  lipoprotein, VacJ family  42.45 
 
 
251 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2729  lipoprotein, VacJ family  42.45 
 
 
251 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02233  hypothetical protein  42.45 
 
 
251 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1311  VacJ family lipoprotein  42.45 
 
 
251 aa  188  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.561225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  43.72 
 
 
250 aa  188  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  40.94 
 
 
255 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  42.48 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  38.22 
 
 
256 aa  178  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  37.04 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  35.57 
 
 
304 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  35.83 
 
 
352 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  34.63 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  36.51 
 
 
281 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  34.68 
 
 
261 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  38.66 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  35.44 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  37.56 
 
 
267 aa  128  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  38.1 
 
 
347 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  43.02 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  35.56 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  36.76 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  35.22 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  37.24 
 
 
340 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  34.62 
 
 
266 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  32.93 
 
 
260 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  33.78 
 
 
303 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  32.89 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  32.29 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  34.82 
 
 
296 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  32.87 
 
 
283 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  34.88 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  34.11 
 
 
336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  32.87 
 
 
337 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  32.43 
 
 
291 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  34.42 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  34.48 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  32.31 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  32.41 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  36.73 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  32.49 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  35.65 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  32.41 
 
 
347 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  32.41 
 
 
347 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  32.41 
 
 
347 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  33.62 
 
 
234 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  32.49 
 
 
340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  35.38 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  35.96 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  35.78 
 
 
350 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  32.17 
 
 
234 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  36.71 
 
 
325 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  32.41 
 
 
334 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  32.41 
 
 
334 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  31.74 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  32.05 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  33.77 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  33.77 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  33.77 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  32.87 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  34.23 
 
 
319 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  34.23 
 
 
336 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  34.23 
 
 
336 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
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