202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4021 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
336 aa  674    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  48.06 
 
 
350 aa  319  5e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  61.54 
 
 
352 aa  318  9e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  55.11 
 
 
285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  47.96 
 
 
296 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  47.42 
 
 
261 aa  185  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  44.19 
 
 
252 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  47.74 
 
 
267 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  42.79 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  45.64 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  43.17 
 
 
260 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  41.82 
 
 
249 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  44.23 
 
 
269 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  44.39 
 
 
338 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  44.86 
 
 
340 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  42.08 
 
 
263 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  47.12 
 
 
250 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  44.29 
 
 
250 aa  168  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  41.28 
 
 
267 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  42.38 
 
 
266 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  40.85 
 
 
267 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  40.72 
 
 
303 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  44.67 
 
 
245 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  39.71 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  41.55 
 
 
325 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  44.95 
 
 
260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  43.46 
 
 
291 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  42.35 
 
 
321 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  42.35 
 
 
321 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  42.35 
 
 
320 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  42.35 
 
 
320 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  42.35 
 
 
320 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  44.44 
 
 
260 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  43.75 
 
 
277 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  41.84 
 
 
318 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  45.79 
 
 
336 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  44.88 
 
 
262 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  43.81 
 
 
266 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  44.5 
 
 
296 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  44.21 
 
 
329 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  38.79 
 
 
340 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  39.73 
 
 
336 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  43.68 
 
 
347 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  39.73 
 
 
319 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  42.65 
 
 
269 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  39.73 
 
 
311 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  43.68 
 
 
347 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  43.68 
 
 
347 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  43.16 
 
 
336 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  43.41 
 
 
277 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  41.51 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  39.27 
 
 
319 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  39.27 
 
 
319 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  42.78 
 
 
241 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  42.63 
 
 
336 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  39.27 
 
 
319 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  39 
 
 
234 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  43.16 
 
 
334 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  41.33 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  36.68 
 
 
347 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  43.16 
 
 
334 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  40.65 
 
 
283 aa  152  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  39.8 
 
 
230 aa  151  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  39.6 
 
 
208 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  39.5 
 
 
234 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  45.26 
 
 
321 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  39.3 
 
 
234 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  42.93 
 
 
248 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  44.74 
 
 
330 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  44.74 
 
 
330 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  44.74 
 
 
330 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  44.74 
 
 
327 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  44.74 
 
 
324 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  44.74 
 
 
342 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  44.74 
 
 
310 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  40.89 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  38.12 
 
 
235 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  38.5 
 
 
234 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  37 
 
 
233 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  37.62 
 
 
235 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  37 
 
 
233 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  37.8 
 
 
284 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0891  putative lipoprotein  40.1 
 
 
262 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.363654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  38.74 
 
 
281 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2550  VacJ family lipoprotein  40.1 
 
 
262 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  37.5 
 
 
229 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  37.62 
 
 
235 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  40.82 
 
 
258 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  37.95 
 
 
235 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  34.53 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  40.69 
 
 
220 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  36.6 
 
 
304 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0116  VacJ family lipoprotein  40.59 
 
 
261 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211994  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2480  VacJ-like lipoprotein  36.87 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.0468041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0140  VacJ family lipoprotein  36.87 
 
 
273 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  34.17 
 
 
290 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  38.98 
 
 
295 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  40.72 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  35.83 
 
 
274 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  39.22 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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