202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0116 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



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Replicon accession
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% identity
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0116  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0891  putative lipoprotein  87.4 
 
 		 262 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.363654  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2550  VacJ family lipoprotein  86.26 
 
 		 262 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0140  VacJ family lipoprotein  45.8 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2480  VacJ-like lipoprotein  49.36 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.0468041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2035  VacJ family lipoprotein  43.12 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  41.39 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  40.61 
 
 		 352 aa  142  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  40.59 
 
 		 336 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  35.96 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  38.5 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  37.98 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  37.83 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  33.93 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  36.73 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  35.82 
 
 		 296 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  36.04 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  37.95 
 
 		 296 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  38.18 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  35.92 
 
 		 338 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  35.65 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  35.63 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 		 295 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  33.04 
 
 		 350 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  35.39 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  36.25 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  36.1 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  35.37 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  38.24 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  33.33 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  33.49 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  36.75 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  33.74 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  32.9 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  34.22 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  35.4 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  37.39 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0220  VacJ family lipoprotein  32.4 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  36.73 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  36.21 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  35.71 
 
 		 347 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2132  VacJ family lipoprotein  46.32 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000157354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  36.8 
 
 		 235 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  38.2 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  34.13 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  39.42 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  34.04 
 
 		 234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  35.71 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  35.71 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  36.41 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  36.04 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  33.79 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  34.65 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1970  VacJ family lipoprotein  35 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  0.0740313 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  35.02 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  34.32 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  34.4 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  35.1 
 
 		 334 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  35.85 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  35.41 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  35.93 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  37.2 
 
 		 235 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  37.5 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  49.23 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  35.58 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  35 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  32.24 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  35 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  35 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  35.71 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  36.05 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  34.55 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  35.68 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  35.68 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  34.38 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  40.1 
 
 		 301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  42.31 
 
 		 336 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  34.88 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  34.93 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  34.93 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  34.93 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  34.93 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  33.48 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  36.1 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  34.67 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  34.76 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0055  VacJ-like lipoprotein  32.23 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0055  VacJ-like lipoprotein  35.82 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.743056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  34.82 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  33.33 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  34.57 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  44.93 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  34.56 
 
 		 319 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  35.04 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  33.62 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  33.93 
 
 		 336 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  33.19 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  32.02 
 
 		 284 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  37.29 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  34.1 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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