202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2035 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2035  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 241 aa  490  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2480  VacJ-like lipoprotein  47.86 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.0468041 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2550  VacJ family lipoprotein  42.24 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0891  putative lipoprotein  42.24 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.363654  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0116  VacJ family lipoprotein  41.77 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0140  VacJ family lipoprotein  40.85 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  37.77 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  37.87 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  38.31 
 
 		 336 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
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NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  38.76 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  38.28 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  41.36 
 
 		 315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  39.53 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  37.14 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  38.86 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  37.12 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  38.64 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  40.45 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  36.97 
 
 		 338 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  35.81 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  36.48 
 
 		 340 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  38.16 
 
 		 352 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  37.88 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  36.54 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 		 296 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  35 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0055  VacJ-like lipoprotein  37.44 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.743056  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  35.59 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  38.89 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  38.5 
 
 		 350 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  36.09 
 
 		 317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  35 
 
 		 347 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  37.89 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  37.99 
 
 		 277 aa  118  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  38 
 
 		 285 aa  118  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  35.58 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  37.69 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  34.55 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1970  VacJ family lipoprotein  42.76 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  0.0740313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  34.55 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  34.55 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
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NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  33.76 
 
 		 334 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
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NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  34.36 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
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NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  38.6 
 
 		 220 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  35.47 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
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NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  35.24 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
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NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  34.19 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  34.72 
 
 		 330 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  34.72 
 
 		 324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  36.84 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  34.72 
 
 		 330 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  34.72 
 
 		 327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  34.72 
 
 		 330 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  34.72 
 
 		 342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  34.72 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  34.72 
 
 		 321 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  34.65 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  33.75 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  36.16 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  33.47 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  33.91 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  37.56 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  37.86 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  35.98 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  40.49 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  35.98 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  36.65 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  33.19 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  40.49 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  35.56 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  34.22 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  38.19 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2594  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.123162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  36.59 
 
 		 336 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  34.51 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  35.55 
 
 		 274 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  38.16 
 
 		 277 aa  108  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  34.29 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  41.67 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  34.18 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2746  lipoprotein, VacJ family  33.47 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0633065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2621  lipoprotein, VacJ family  33.47 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2581  lipoprotein VacJ family  33.47 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2635  VacJ family lipoprotein  33.47 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.0000000000141324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2532  lipoprotein, VacJ family  33.47 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  34.6 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  34.12 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02272  predicted lipoprotein  33.47 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  41.77 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  32.57 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2729  lipoprotein, VacJ family  33.47 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2505  VacJ family lipoprotein  33.47 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2642  VacJ family lipoprotein  33.47 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1307  VacJ family lipoprotein  33.47 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  36.84 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3490  lipoprotein, VacJ family  33.47 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012892  B21_02233  hypothetical protein  33.47 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  35.91 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  37.62 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
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