202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1886 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  557  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  94.81 
 
 
267 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  69.77 
 
 
270 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  69.77 
 
 
270 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  68.75 
 
 
262 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  70.98 
 
 
274 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  69.55 
 
 
275 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  75.86 
 
 
248 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  67.17 
 
 
274 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1239  VacJ family lipoprotein  69.75 
 
 
256 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  65.65 
 
 
257 aa  325  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  49.04 
 
 
252 aa  205  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  39.01 
 
 
255 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2690  hypothetical protein  52.74 
 
 
254 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1855  VacJ family lipoprotein  47.83 
 
 
262 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2363  VacJ family lipoprotein  42.11 
 
 
262 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0995  VacJ-like lipoprotein  45.05 
 
 
747 aa  188  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.4612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  44.39 
 
 
251 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  46.8 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  47.24 
 
 
234 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  46.5 
 
 
229 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  47.74 
 
 
234 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  48.12 
 
 
233 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  36.96 
 
 
290 aa  159  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  40.91 
 
 
233 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  42.03 
 
 
235 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  44.44 
 
 
296 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  53.73 
 
 
208 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  41.92 
 
 
235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  48.48 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  40.58 
 
 
235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  42.36 
 
 
260 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  54.48 
 
 
234 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  41.92 
 
 
235 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  51.49 
 
 
234 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  50.68 
 
 
336 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  50.68 
 
 
336 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  50.68 
 
 
336 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  50.34 
 
 
319 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  50.34 
 
 
319 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  50.34 
 
 
319 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  43.94 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  50.34 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  50.34 
 
 
311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  51.02 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  51.02 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  51.02 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  44.28 
 
 
267 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  50.34 
 
 
318 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  44.28 
 
 
267 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  50.34 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  50.34 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  53.73 
 
 
340 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  49.02 
 
 
249 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  51.02 
 
 
325 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  41.92 
 
 
338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  42.79 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  44.25 
 
 
261 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  47.83 
 
 
258 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  41.33 
 
 
281 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  47.62 
 
 
269 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  43.07 
 
 
252 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  45.29 
 
 
220 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2132  VacJ family lipoprotein  36.84 
 
 
318 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000157354  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  49.66 
 
 
245 aa  142  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  47.95 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  43.27 
 
 
267 aa  138  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  49.31 
 
 
277 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  49.64 
 
 
329 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  43.71 
 
 
340 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  48.18 
 
 
337 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  43.75 
 
 
315 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  45.45 
 
 
250 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  44.16 
 
 
330 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  44.16 
 
 
330 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  44.16 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  44.16 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  43.71 
 
 
347 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  44.89 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  44.16 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  44.16 
 
 
342 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  44.16 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  44.05 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  41.86 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  46.72 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  42.61 
 
 
315 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  48.18 
 
 
347 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  42.86 
 
 
261 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  47.76 
 
 
321 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  48.18 
 
 
347 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  43.31 
 
 
334 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  48.18 
 
 
347 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  48.95 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  39.81 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  50.74 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  37.5 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  44.25 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  46.48 
 
 
291 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
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NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  37.88 
 
 
352 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  48.18 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
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