202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2657 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 251 aa  517  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  48.23 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  42.86 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0995  VacJ-like lipoprotein  45.93 
 
 		 747 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.4612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  46.73 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1855  VacJ family lipoprotein  43.72 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1239  VacJ family lipoprotein  42.52 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  46.15 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2363  VacJ family lipoprotein  42.13 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  46.63 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  46.34 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  46.15 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2690  hypothetical protein  46.83 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  45.41 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  45.37 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  44.39 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  44.88 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  44.39 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  44.39 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2132  VacJ family lipoprotein  41.86 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000157354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  44.71 
 
 		 271 aa  155  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  40 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  37.55 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  39.63 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  41.43 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  41.9 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  43.89 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  37.4 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  40.8 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  53.73 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  48.53 
 
 		 234 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  34.41 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  39.3 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  40.5 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  37.4 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  50.74 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  35.37 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  38.5 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  34.14 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  38.5 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  35.9 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  33.86 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  33.47 
 
 		 338 aa  141  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  38.61 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  52.24 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  48.15 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  35.48 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  40 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  50 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  50 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  50.39 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  36.79 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  37.4 
 
 		 277 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  36.63 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  37.26 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  48.44 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  39 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  47.41 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  34.94 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  48.15 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  36.65 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  38.5 
 
 		 336 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  38.5 
 
 		 319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1820  VacJ family lipoprotein  37.6 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  38.5 
 
 		 336 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  40.5 
 
 		 250 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  40.5 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  38 
 
 		 319 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  38 
 
 		 319 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  38 
 
 		 319 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  49.22 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  38 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  37.38 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  36.1 
 
 		 325 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  35.96 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  37.38 
 
 		 320 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  37.38 
 
 		 320 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  37.38 
 
 		 320 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1970  VacJ family lipoprotein  46.21 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  0.0740313 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  36.76 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  35.17 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  36.89 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  45.59 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  35.92 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  36.89 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  48.51 
 
 		 315 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  30.42 
 
 		 330 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  30.42 
 
 		 324 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  34.33 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
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NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  30.42 
 
 		 330 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  33.47 
 
 		 315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  35.58 
 
 		 352 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  30.42 
 
 		 330 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  34.58 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  30.42 
 
 		 327 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  30.42 
 
 		 342 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  30.42 
 
 		 310 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  43.87 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  43.87 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
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NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  34.95 
 
 		 350 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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