221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0995 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



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Replicon accession
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% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0995  VacJ-like lipoprotein  100 
 
 		 747 aa  1527    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.4612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0978  hypothetical protein  49.38 
 
 		 425 aa  422  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2691  hypothetical protein  45.5 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1774  hypothetical protein  44.55 
 
 		 429 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000898426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2364  hypothetical protein  44.95 
 
 		 430 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1854  hypothetical protein  44.95 
 
 		 430 aa  349  8e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2658  hypothetical protein  41.36 
 
 		 431 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0228  hypothetical protein  40.57 
 
 		 480 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.318779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1240  putative serine protein kinase, PrkA  38.46 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.585317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1603  hypothetical protein  37.91 
 
 		 432 aa  286  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0980837  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3981  hypothetical protein  38.27 
 
 		 432 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480409  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22310  hypothetical protein  36.01 
 
 		 453 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0322432  hitchhiker  1.27053e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1887  hypothetical protein  35.84 
 
 		 453 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1738  hypothetical protein  37.78 
 
 		 432 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1330  hypothetical protein  37.78 
 
 		 432 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1288  hypothetical protein  37.19 
 
 		 432 aa  280  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1621  hypothetical protein  36.36 
 
 		 432 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3759  hypothetical protein  35.19 
 
 		 432 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.871717  normal  0.122794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35080  hypothetical protein  36.11 
 
 		 432 aa  269  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  54.9 
 
 		 252 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2690  hypothetical protein  52.63 
 
 		 254 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2363  VacJ family lipoprotein  48.62 
 
 		 262 aa  218  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1855  VacJ family lipoprotein  48.17 
 
 		 262 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  47.79 
 
 		 255 aa  209  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  45.93 
 
 		 251 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  40 
 
 		 274 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  42.72 
 
 		 275 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  39.54 
 
 		 274 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  42.72 
 
 		 248 aa  190  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  45.05 
 
 		 270 aa  187  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  45.05 
 
 		 267 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  45.41 
 
 		 270 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  45.54 
 
 		 270 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1239  VacJ family lipoprotein  44.17 
 
 		 256 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  43.69 
 
 		 257 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  45.81 
 
 		 262 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  42.51 
 
 		 295 aa  179  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2131  hypothetical protein  27.06 
 
 		 432 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0712183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  35.29 
 
 		 234 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  34.84 
 
 		 234 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  39.8 
 
 		 234 aa  147  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  41.76 
 
 		 261 aa  147  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  36.82 
 
 		 229 aa  145  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  37.86 
 
 		 208 aa  145  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  35 
 
 		 235 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  36.59 
 
 		 249 aa  144  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  35.18 
 
 		 235 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  35 
 
 		 235 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  35 
 
 		 235 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  45.93 
 
 		 337 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  35 
 
 		 233 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  35.92 
 
 		 252 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  36.84 
 
 		 234 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  45.52 
 
 		 266 aa  141  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  48.51 
 
 		 336 aa  142  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  44.65 
 
 		 290 aa  141  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  40.56 
 
 		 338 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  34.5 
 
 		 233 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  36.76 
 
 		 248 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  43.53 
 
 		 266 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  43.7 
 
 		 334 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  40.56 
 
 		 340 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  43.7 
 
 		 334 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  41.52 
 
 		 271 aa  138  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2132  VacJ family lipoprotein  36.19 
 
 		 318 aa  138  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000157354  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  42.96 
 
 		 329 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  42.96 
 
 		 347 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  42.96 
 
 		 347 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  42.96 
 
 		 347 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  45.52 
 
 		 303 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  44.03 
 
 		 327 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  44.03 
 
 		 330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  44.03 
 
 		 321 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  44.03 
 
 		 330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  36.63 
 
 		 296 aa  135  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  44.03 
 
 		 330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 		 315 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  44.03 
 
 		 324 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  44.03 
 
 		 342 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  44.03 
 
 		 310 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  35.82 
 
 		 318 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  35.82 
 
 		 340 aa  134  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  35.82 
 
 		 321 aa  134  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  36.87 
 
 		 291 aa  133  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  35.82 
 
 		 321 aa  134  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  35.82 
 
 		 320 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  35.82 
 
 		 320 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  35.82 
 
 		 320 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  35 
 
 		 284 aa  132  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  34.52 
 
 		 347 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  33.83 
 
 		 325 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  40 
 
 		 277 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  38.6 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  35.03 
 
 		 336 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  34.52 
 
 		 267 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  35.03 
 
 		 336 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  35.03 
 
 		 319 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  34.52 
 
 		 267 aa  129  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  34.52 
 
 		 311 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  40.59 
 
 		 263 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
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