202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1775 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  100 
 
 
252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2690  hypothetical protein  62.34 
 
 
254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1855  VacJ family lipoprotein  57.09 
 
 
262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2363  VacJ family lipoprotein  57.49 
 
 
262 aa  301  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0995  VacJ-like lipoprotein  54.9 
 
 
747 aa  228  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.4612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  48.76 
 
 
255 aa  226  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  47.85 
 
 
275 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  47.85 
 
 
274 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  47.85 
 
 
248 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  45.45 
 
 
270 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  41.64 
 
 
274 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  45.45 
 
 
267 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1239  VacJ family lipoprotein  49.52 
 
 
256 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  48.25 
 
 
270 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  47.81 
 
 
270 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  49.28 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  44.14 
 
 
251 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  44.86 
 
 
295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  44 
 
 
257 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  39.29 
 
 
234 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  39.29 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  40.2 
 
 
208 aa  138  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  43.98 
 
 
271 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0364  VacJ family lipoprotein  48.19 
 
 
237 aa  135  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  38.46 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  38.65 
 
 
295 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  39.9 
 
 
234 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2132  VacJ family lipoprotein  37.32 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000157354  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  38.42 
 
 
290 aa  133  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  36.22 
 
 
233 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  37.93 
 
 
352 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  37.5 
 
 
263 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  36.73 
 
 
229 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  36.73 
 
 
233 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  37.69 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  37.69 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  37.69 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  37.69 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  37.69 
 
 
321 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  42.51 
 
 
245 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  37.69 
 
 
321 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  37.37 
 
 
325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  38.19 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  40.68 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  38.19 
 
 
319 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  38.38 
 
 
336 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  38.38 
 
 
336 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  45.67 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  37.24 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  35.61 
 
 
315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  38.12 
 
 
317 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  45.67 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  45.67 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  44.88 
 
 
235 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  37.69 
 
 
319 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  40 
 
 
252 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  37.69 
 
 
319 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  37.88 
 
 
336 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  37.69 
 
 
319 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  37.76 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  50 
 
 
315 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  43.26 
 
 
230 aa  125  5e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  36.14 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  36 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  38.54 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  34.45 
 
 
281 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  46.21 
 
 
296 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  36.41 
 
 
340 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  47.69 
 
 
336 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  33.6 
 
 
242 aa  123  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  35.68 
 
 
336 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  39.89 
 
 
233 aa  122  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  45.8 
 
 
338 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  36.45 
 
 
254 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0561  surface lipoprotein-like  40.49 
 
 
292 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.361173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  46.27 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  40.35 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  39.18 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  45.93 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  35.68 
 
 
350 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  40.1 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  37.19 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  35.1 
 
 
347 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  35.68 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  34.31 
 
 
258 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  35.87 
 
 
253 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1563  VacJ family lipoprotein  40.46 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  44.78 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  35.27 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  44.03 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  38.46 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  44.03 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
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NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  39.29 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  37.85 
 
 
277 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
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NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  35.38 
 
 
236 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  36.06 
 
 
241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  42.55 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
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NC_008044  TM1040_2480  VacJ-like lipoprotein  33.95 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.0468041 
 
 
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NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  38.18 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  47.76 
 
 
266 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
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