202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2363 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2363  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 262 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1855  VacJ family lipoprotein  93.13 
 
 		 262 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2690  hypothetical protein  70.13 
 
 		 254 aa  340  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  59.05 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0995  VacJ-like lipoprotein  48.62 
 
 		 747 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.4612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  40.32 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  42.13 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  46.86 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  47.34 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  45.59 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  45.1 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  43.54 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  42.03 
 
 		 248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  45.63 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  37.97 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  38.93 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  37.41 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1239  VacJ family lipoprotein  43.41 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  42.36 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  39.3 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  37.81 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  38.31 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  38.61 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  35.32 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  37 
 
 		 234 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  36.97 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  38.21 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  35 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  33.33 
 
 		 284 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  33.83 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  34.33 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  39.43 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  36.76 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  33.33 
 
 		 235 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  32.84 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  37.44 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  40.83 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  40.83 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  40.83 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  40.83 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  34.63 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  33.5 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  33.5 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  33.01 
 
 		 318 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  33.01 
 
 		 321 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  33.01 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  33.01 
 
 		 321 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  33.01 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  33.01 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  32.86 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  32.94 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  48.12 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  37.56 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 		 317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  30.23 
 
 		 315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  29.96 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  40.94 
 
 		 245 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  37.7 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  37.17 
 
 		 338 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  37.36 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2132  VacJ family lipoprotein  34.85 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000157354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  33.5 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  37.35 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  35.71 
 
 		 329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0561  surface lipoprotein-like  32.78 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.361173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  36.26 
 
 		 334 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  33.5 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  36.26 
 
 		 334 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  32.32 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  33.46 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  31.78 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  35.16 
 
 		 347 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  34.5 
 
 		 352 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  35.16 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  35.16 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  33.5 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  32.11 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  32.18 
 
 		 347 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  31.2 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  38.69 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  35.36 
 
 		 330 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  35.36 
 
 		 330 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  34.63 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  35.36 
 
 		 330 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  35.36 
 
 		 327 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  35.36 
 
 		 324 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  35.36 
 
 		 342 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  35.36 
 
 		 310 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  31.2 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  38.93 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  35.36 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  31.27 
 
 		 249 aa  112  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  31.43 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  34.8 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_4150  VacJ-like lipoprotein  32.97 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  31.36 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  30.15 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
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NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  32.68 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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