202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4165 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  100 
 
 		 291 aa  587  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  71.25 
 
 		 277 aa  359  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  53.11 
 
 		 329 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  56.52 
 
 		 337 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  58.01 
 
 		 321 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  55.19 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  55.19 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  55.19 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  56.41 
 
 		 342 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  56.41 
 
 		 310 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  57.39 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  55.98 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  55.98 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  56.96 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  56.96 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  55.79 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  55.56 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  55.9 
 
 		 334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  58.08 
 
 		 340 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  56.85 
 
 		 336 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  49.5 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  53.78 
 
 		 347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  53.25 
 
 		 266 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  53.45 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  50.41 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  49.03 
 
 		 267 aa  241  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  48.65 
 
 		 267 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  47.78 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  51.75 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  51.75 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  51.75 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  51.75 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  50.86 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  50.23 
 
 		 261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  51.32 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  50.43 
 
 		 321 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  46.8 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  51.22 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  47.26 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  50.23 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  47.98 
 
 		 250 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  47.98 
 
 		 250 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  48.28 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  49.77 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  49.77 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  49.77 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  49.77 
 
 		 319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  49.77 
 
 		 319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  49.77 
 
 		 319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  45 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  47.06 
 
 		 248 aa  211  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  45.96 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  45.85 
 
 		 277 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  45.34 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  47.53 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  47.09 
 
 		 234 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  45.7 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  42.59 
 
 		 269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  45.25 
 
 		 235 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 262 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  42.36 
 
 		 234 aa  195  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  40.24 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  44.81 
 
 		 271 aa  192  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  47.24 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  44.34 
 
 		 235 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  50 
 
 		 245 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  41.32 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  44.65 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  43.3 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  42.86 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  44 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  43.56 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  42.67 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  41.7 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  41.7 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  43.56 
 
 		 229 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  46.94 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  43.23 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  43.23 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  44.02 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  40 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  40.34 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  42 
 
 		 220 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  41.56 
 
 		 336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  39.41 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  41.55 
 
 		 352 aa  162  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  43.35 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  41.21 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1154  VacJ family lipoprotein  40.34 
 
 		 273 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  44.27 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  42.79 
 
 		 350 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  42.79 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  38.78 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  40.09 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  35.77 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  39.64 
 
 		 260 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0220  VacJ family lipoprotein  38.05 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009707  JJD26997_0279  VacJ family lipoprotein  42.05 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE1563  VacJ family lipoprotein  41.03 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_1374  VacJ family lipoprotein  41.54 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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