202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4150 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4150  VacJ-like lipoprotein  100 
 
 		 296 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0561  surface lipoprotein-like  41.41 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.361173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  41.33 
 
 		 290 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  38.61 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  35.29 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  35.98 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  31.94 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  31.17 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  35.35 
 
 		 338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  38.12 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  36.55 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  36.65 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  38.02 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  35.9 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  38.34 
 
 		 295 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  36.76 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  33.18 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  37.7 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  37.13 
 
 		 234 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  36.1 
 
 		 340 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  39.59 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  38.74 
 
 		 340 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  36.32 
 
 		 245 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1820  VacJ family lipoprotein  35.5 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  36.63 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  42.03 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  30.96 
 
 		 230 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  33.17 
 
 		 233 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  39.11 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  36 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  34.85 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  35.08 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  33.97 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  32.54 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2363  VacJ family lipoprotein  32.97 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  34.98 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  33.51 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  34.98 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  34.98 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  34.98 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  37.04 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  32.68 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  37.04 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  37.04 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  34.98 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  33.49 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  34.98 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  33.49 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  34.98 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  33.49 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  34.98 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  34.39 
 
 		 241 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  33.49 
 
 		 319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  33.01 
 
 		 236 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  35.45 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  34.3 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  33.49 
 
 		 347 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  33.49 
 
 		 347 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  36.51 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  34.5 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  36.51 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  36.23 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  36.23 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  35.98 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2301  surface lipoprotein-like  30.89 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000223311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  32.17 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  32.18 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  38.78 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  34.42 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  33.02 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1005  VacJ family lipoprotein  29.08 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18106  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  33.02 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  33.02 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  33.02 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  34.5 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  33.33 
 
 		 229 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2480  VacJ-like lipoprotein  34.18 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.0468041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1855  VacJ family lipoprotein  33.33 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  34.19 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  41.56 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  37.75 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  36.13 
 
 		 208 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  33 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  34.86 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  35.79 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  33.86 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  32.32 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  31.06 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  34.01 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  32 
 
 		 235 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  32 
 
 		 235 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  39.42 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  32.81 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  32.5 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  39.42 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0364  VacJ family lipoprotein  31.5 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  40.44 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_2132  VacJ family lipoprotein  31.97 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000157354  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  43.75 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  28.68 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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