202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0856 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 259 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1820  VacJ family lipoprotein  56.3 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2301  surface lipoprotein-like  50.69 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000223311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  45.71 
 
 		 284 aa  198  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0532  VacJ family lipoprotein  46.27 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  40.65 
 
 		 253 aa  194  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  43.21 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  45.77 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  42.19 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  44.78 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  39.73 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  38.94 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  41.12 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  40.76 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0364  VacJ family lipoprotein  39.22 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  42.93 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  42.64 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0055  VacJ-like lipoprotein  35.19 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.743056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  42.05 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  42.05 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  39.55 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  41.41 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  42.05 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  40.29 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  35.37 
 
 		 235 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  34.96 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  35.37 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  40.31 
 
 		 208 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  39.39 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  39.59 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1005  VacJ family lipoprotein  32.68 
 
 		 249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  40.1 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1563  VacJ family lipoprotein  36.92 
 
 		 232 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  35.06 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  39.18 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  41.12 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  40.2 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  37.45 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  40.21 
 
 		 277 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1374  VacJ family lipoprotein  36.32 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  38.97 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  39.09 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
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NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  36.05 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
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NC_009707  JJD26997_0279  VacJ family lipoprotein  35.58 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  37.13 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  38.14 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  37.69 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  35.04 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  35.04 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  34.29 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  38.86 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  37.37 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  38.97 
 
 		 220 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  36.73 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  38.27 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  37.69 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  37.91 
 
 		 347 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  37.63 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1359  VacJ-like lipoprotein  37.34 
 
 		 350 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.022936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  39.49 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  37.78 
 
 		 251 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  36.82 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  38.73 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  33.07 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  37.93 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  35.9 
 
 		 325 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  35 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  35 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  35 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  35 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  35 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  35 
 
 		 321 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  35.68 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  35.68 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2035  VacJ family lipoprotein  36.54 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  36.55 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  35.53 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  35.68 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  35.68 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  30.83 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  35.64 
 
 		 266 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  36.73 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  36.22 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  35.53 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  36.36 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  35.18 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  34.33 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  35.18 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  35.18 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  35.18 
 
 		 336 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  33.33 
 
 		 295 aa  118  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2594  VacJ family lipoprotein  32.08 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.123162  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  39.5 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  34 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal  1 
 
 
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NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  35.53 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  35.75 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  36.04 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  34.52 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_4150  VacJ-like lipoprotein  31.34 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  45.99 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
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