202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2594 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2594  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 270 aa  557  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.123162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1970  VacJ family lipoprotein  43.96 
 
 		 260 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  0.0740313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  40.19 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  39.02 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  39.05 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  39.05 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  36.76 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  39.05 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  38.42 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  37.02 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  35.78 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  36.84 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  35.24 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  37.38 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  36.27 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1154  VacJ family lipoprotein  34.72 
 
 		 273 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  36.27 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  36.27 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  36.27 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  36.27 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  37.25 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  35.78 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  37.93 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  36.89 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  36.4 
 
 		 259 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  37.93 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  38 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  38 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0055  VacJ-like lipoprotein  37.93 
 
 		 290 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.743056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  38.12 
 
 		 317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  37.5 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  37.5 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  37.5 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  37.5 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  35.71 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  35.44 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  35.14 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  36.45 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  39 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  38.18 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  38.18 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  37.25 
 
 		 262 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  36.74 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  37.13 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  34.7 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  35.5 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  35.51 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  35.78 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  33.97 
 
 		 324 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  33.97 
 
 		 342 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  33.97 
 
 		 310 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  38.92 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  34.6 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  31.17 
 
 		 230 aa  123  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  34.3 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  33.17 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  34.63 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  36.59 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  33.49 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  33.49 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  36.22 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  33.49 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  33.49 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  33.65 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  33.82 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  33.94 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  32.02 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  33.18 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  33.33 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  36.32 
 
 		 336 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  34.43 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  34.43 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  33.63 
 
 		 233 aa  119  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  35.1 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  31.62 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  31.51 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  32.44 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  33.92 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  32.44 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  32.44 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  32.2 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  37.56 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  34.29 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  32.54 
 
 		 334 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  30.54 
 
 		 329 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  32.54 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  32.9 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  36.76 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  32.06 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  33.96 
 
 		 233 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  33.67 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  31.95 
 
 		 236 aa  116  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  31.47 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  34.13 
 
 		 234 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  33.97 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  33.33 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  35.41 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  32.69 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  35.14 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>